1 Úvod
i když členové kmene Ascomycota, zejména Sacchromyces cerevisiae, jsou nejvíce studovány houby, existují 80.000 známých druhů Hub království. Tam je velká rozmanitost v království, a to od malých neškodných jednobuněčné kvasinky jako S. cerevisiae k velké rostliny patogen Armillaria ostoyae, jeden z největších organismů na světě. Tento druh je členem kmene Basidiomycota, kmen méně dobře pochopený než Ascomycota.
zatímco žádný druh basidiomycete nebyl studován tak podrobně jako s. cerevisiae, jedná se o fascinující a rozmanitou skupinu organismů. Basidiomycety produkují mnoho zajímavých sekundárních metabolitů používaných v medicíně, průmyslu a výzkumu. Členové kmene představují asi 10% (40 druhů) známých lidských houbových patogenů (Morrow a Fraser, 2009). S nástupem epidemie AIDS, zejména jeden basidiomycete, Cryptococcus neoformans, vzrostl z málo známého patogenu na jednoho z nejlepších houbových zabijáků imunokompromitovaných pacientů.
C. neoformans se primárně vyskytuje jako haploidní kvasnice a je široce přítomen v životním prostředí po celém světě, včetně ptačích exkrementů, půdy a kůry stromů. Studie ukázaly, že lidé přicházejí do častého kontaktu s C. neoformans: jedinci bez historie kryptokokóza mají protilátky proti kvasinek (Chen et al., 1999) a zdá se, že většina dětí byla vystavena ve věku pěti let (Goldman et al., 2001). To naznačuje, že většina jedinců se setkává s C. neoformans v životním prostředí, s největší pravděpodobností vdechováním do plic. Imunokompetentní jedinci jsou obvykle schopni ovládat a udržet infekci, což často vede k asymptomatické latentní stav infekce. Pokud se imunitní systém pacienta později zhorší, může se latentní infekce znovu aktivovat. V případě imunokompromitovaného jedince může plicní infekce vést k pneumonii následované šířením krevním řečištěm do jiných orgánů. C. neoformans je jedním z mála druhů hub známo, že přes krev–bariéra mozku a infikovat mozek (Kim, 2006), což vede k meningitidě, že je fatální, pokud se neléčí. Když epidemie AIDS začala v 80. letech, došlo k souběžnému nárůstu případů kryptokokózy po celém světě. V posledních letech zvýšené používání antiretrovirové terapie a antimykotik snížilo celkový výskyt fatální kryptokokové meningitidy. Přesto v oblastech, kde je přístup k léčbě omezen, zůstává C. neoformans důležitým problémem v péči o imunokompromitované pacienty, včetně pacientů s AIDS, rakovinou a transplantací orgánů. Kromě toho, nedávné propuknutí kryptokokózy u imunokompetentních jedinců v Severozápadním Pacifiku obavy o riziko kryptokokové infekce i u jinak zdravých jedinců (Bartlett et al., 2008; Hoang et al., 2004).
jako haploidní kvasinková buňka je C. neoformans přístupný mnoha rozsáhlým protokolům, které byly vyvinuty pro S. cerevisiae, vyžadující ve většině případů jen několik úprav. Avšak poté, co se odchyloval od ascomycete linie před 400 miliony let (mya) (Taylor a Berbee, 2006), existují značné rozdíly v jeho mobilní strojní zařízení a životního cyklu (viz níže). Srovnávací genomika slibuje výnos bohaté informace o vývoji sdílených a rozcházely geny, proteiny a cesty, stejně jako nabízí vhled do rozdílů mezi druhy, které umožňují jeden kvasinky existovat jako neškodný saprofyt a další příčinou smrtelné infekce v savčí hostitele.