Dne 1. ledna 1918, 12 studentů ze čtyř států se setkali s Norou Komory v pokoji v patře Církve Boží Nakladatelství v Clevelandu, Tennessee. Toto první třídní setkání církve Boží Bible Training School (BTS) vedlo k založení Lee University. Zpočátku Chambers sloužil jako jediný člen fakulty, a tucet studentů tvořilo celý studentský sbor. První dva absolventi získali diplomy v dubnu 1919 a v září 1919 byl zahájen korespondenční program, který zvýšil celkový zápis školy na 788 studentů. Během následujících desetiletí, BTS rozšířila svou fakultu a osnov a přestěhoval se do areálu v Sevierville v 1938.
V roce 1947 BTS přestěhoval zpátky do Clevelandu, obsadil nedávno koupil větší areál, a byl jmenován Lee College na počest Flavius J. Lee, časný vůdce v názvu a druhého prezidenta školy. Vysoká škola rozšířila svůj důraz na zahrnutí biblických studií i tradičních svobodných umění do čtyřletého učebního plánu. V 1959 Lee Bible College byla akreditována akreditační asociace biblických vysokých škol, a 1960, junior college byla akreditována Jižní asociace vysokých škol a škol (SACS). V roce 1969 SACS udělila Lee plnou akreditaci jako čtyřletá vysoká škola svobodných umění. Od roku 1970 do roku 1990, Lee zažil obrovský růst, zvýšení jeho zápis na více než 2 600 studentů, což je jeden z největších a nejrychleji rostoucích soukromých vysokých škol v Tennessee. V roce 1990 vysokou přidanou své první postgraduální program, Mistr Církevní Hudby, jeho dvacet-osm majorů. V 1996 studenti ze čtyřiceti šesti států a dvaceti sedmi zahraničních zemí navštěvovali kurzy na šedesáti akrovém kampusu v centru Clevelandu.
V roce 1996 Lee College Představenstva se rozhodl změnit školu dramaticky spuštěním plán pro instituce, která volala po reorganizaci a označení jako Lee University. V srpnu 1, 1997, Lee University byla formálně na svém místě; to zahrnovalo čtyři akademické jednotky: Vysoká škola svobodných umění a věd, škola hudby, škola Ministerstva, a Vysoká škola školství. Rada zůstala nedotčena posláním, institucionální cíle, politiky, a provozní postupy instituce. To znamená, Lee University má silné vazby na své mateřské denominaci a její závazek poskytovat vysoce kvalitní, cenově dostupné vzdělání v Křesťanském kontextu i nadále řídit instituce priority. Lee University zůstal koedukované od svého založení a v souladu s jeho Letniční dědictví, provozuje Letniční Research Center, který se může pochlubit nejrozsáhlejší sbírky k dispozici na Pentecostalism. Rozhodnuto zachovat svou obecněji založenou křesťanskou identitu, Lee University se identifikuje jako “ kampus, kde je Kristus králem.“