Glykogen: Glykogen ist die häufigste Form von Glukose bei Tieren und kommt besonders häufig in Muskel- und Leberzellen vor. Es erscheint in der elektronenmikroskopischen Aufnahme als Cluster oder eine Rosette von Betateilchen, die Ribosomen ähneln und sich in der Nähe des glatten endoplasmatischen Retikulums befinden. Glykogen ist eine wichtige Energiequelle der Zelle und wird daher bei Bedarf verfügbar sein. Die für die Glykogenolyse verantwortlichen Enzyme bauen Glykogen in einzelne Glukosemoleküle ab und können von mehreren Organen des Körpers genutzt werden.
Lipide: Lipide sind Triglyceride in Speicherform ist die häufigste Form von Einschlüssen, die nicht nur in spezialisierten Zellen (Adipozyten) gespeichert sind, sondern auch als Tröpfchen in verschiedenen Zelltypen, insbesondere Hepatozyten, lokalisiert sind. Diese sind bei Körpertemperatur flüssig und erscheinen in lebenden Zellen als refraktive kugelförmige Tröpfchen. Lipid liefert mehr als doppelt so viele Kalorien pro Gramm wie Kohlenhydrate. Bei Bedarf dienen sie als lokaler Energiespeicher und als potenzielle Quelle für kurze Kohlenstoffketten, die von der Zelle bei der Synthese von Membranen und anderen lipidhaltigen Strukturkomponenten oder sekretorischen Produkten verwendet werden.
Kristalle: Kristalline Einschlüsse sind seit langem als normale Bestandteile bestimmter Zelltypen wie Sertoli-Zellen und Leydig-Zellen des menschlichen Hodens und gelegentlich in Makrophagen anerkannt. Es wird angenommen, dass diese Strukturen kristalline Formen bestimmter Proteine sind, die sich überall in der Zelle befinden, z. B. im Zellkern, in den Mitochondrien, im endoplasmatischen Retikulum, im Golgi-Körper und frei in der zytoplasmatischen Matrix.
Pigmente: Das häufigste Pigment im Körper ist neben Hämoglobin der roten Blutkörperchen Melanin, das von Melanozyten der Haut und der Haare, Pigmentzellen der Netzhaut und spezialisierten Nervenzellen in der Substantia nigra des Gehirns hergestellt wird. Diese Pigmente haben Schutzfunktionen in der Haut und unterstützen den Sehsinn in der Netzhaut, aber ihre Funktionen in Neuronen sind nicht vollständig verstanden. Darüber hinaus zeigen Herzgewebe und Neuronen des Zentralnervensystems ein gelbes bis braunes Pigment namens Lipofuszin, von dem einige glaubten, dass sie lysosomale Aktivität haben.