Le Pen lobte das Brexit-Votum im Vereinigten Königreich im Juni 2016 und die Wahl von Donald Trump zum Präsidenten der Vereinigten Staaten im November 2016 als Beweis für die wachsende Akzeptanz ihrer Prinzipien. Trump hatte auf einer weitgehend Anti-Establishment-, Anti-Immigrations- und anti-islamischen Plattform gekämpft, und sein Erfolg bei den Wählern der Mittelschicht und der ländlichen Bevölkerung schien Le Pen vor den französischen Präsidentschaftswahlen 2017 Gutes zu verheißen. Am 23. April 2017 belegte Le Pen in der ersten Runde der Präsidentschaftswahlen den zweiten Platz hinter Emmanuel Macron, einem Pro-EU-Zentristen, der unter Hollande als Finanzminister gedient hatte.
Nur wenige Tage vor der zweiten Runde veröffentlichten Hacker Zehntausende interner E-Mails aus Macrons Kampagne, die als „massive und koordinierte“ Bemühungen zur Störung der Wahl bezeichnet wurden. Cybersicherheitsfirmen verbanden den Angriff mit derselben mit der russischen Regierung verbundenen Gruppe, die vor den US-Präsidentschaftswahlen 2016 für das Hacken der amerikanischen Demokratischen Partei verantwortlich war. Die französischen Medien-Blackout-Regeln in den Stunden vor der Eröffnung der Umfragen verboten jedoch effektiv die Berichterstattung über den Vorfall, und Le Pen konnte keinen wesentlichen Nutzen aus den Lecks ziehen. Knapp über 75 Prozent der Wahlberechtigten stimmten in der zweiten Runde ab, Frankreichs niedrigste Wahlbeteiligung bei einer Präsidentschaftswahl seit fast einem halben Jahrhundert. Darüber hinaus entschieden sich rund vier Millionen Wähler — fast 9 Prozent derjenigen, die zur Wahl gingen — dafür, leere oder absichtlich verdorbene Stimmzettel abzugeben, um gegen beide Kandidaten zu protestieren. Von den verbleibenden wahlberechtigten Stimmen gewann Le Pen etwa 34 Prozent der Stimmen, fast doppelt so viel wie ihr Vater gegen Jacques Chirac in der zweiten Runde der Wahlen 2002.
Obwohl sie einen entfernten zweiten Platz hinter Macron belegte, erklärte eine trotzige Le Pen, dass der Front National die offizielle Oppositionspartei einer von Macron geführten Regierung geworden sei. Diese Aussage erwies sich als alles andere als wahr, als im Juni 2017 Parlamentswahlen stattfanden. Der Front National eroberte nur acht Sitze, deutlich weniger, als die Partei voraussichtlich gewinnen würde. Le Pen selbst gewann zum ersten Mal einen Parlamentssitz und vertrat Hénin-Beaumont. Der Sieg bedeutete, dass Le Pen vom Sitz im Europäischen Parlament zurücktreten musste, den sie seit 2004 innehatte. Nur zwei Wochen nach ihrem Rücktritt wurde sie von den französischen Behörden wegen Missbrauchs von Geldern während ihrer Zeit als Europaabgeordnete strafrechtlich verfolgt. Das Europäische Amt für Betrugsbekämpfung, eine EU-Einrichtung, die mit der Untersuchung von Wirtschaftsverbrechen und Korruption im Zusammenhang mit EU-Geldern beauftragt ist, behauptete, Le Pen habe rund 5 Mio. € (5,4 Mio. USD) für Geschäfte der Partei National Front falsch ausgegeben.