21.1 Clavispora Lusitaniae Rodrigues de Miranda (1979)
Anamorph: Candida lusitaniae van Uden & do Carmo-Sousa
kasvu YM agarilla: 3 päivän kuluttua 25°C: ssa, solut ovat Subglobooseja, soikeat venymään, 2-6×3-10 µm, ja esiintyvät yksittäin, pareittain tai lyhyinä ketjuina. Kasvu on butyraattista, valkoista tai kermanväristä, kimaltelevaa tai ajoittain himmeää ja rujoa.
glukoosi-hiivauuteliemen kasvu: joskus kasvu voi olla hapanta.
Dalmau plate-viljelmä maissijauhoagarilla: 1 viikon kuluttua 25°C: n lämpötilassa pseudohyphae on runsas ja hyvin kehittynyt. Pesäkkeet voivat olla pseudohyphae-värisiä.
Ascosporesin muodostuminen: Ascit ovat yleensä bilobaatteja, joissa on yksi tai kaksi, harvoin kolme tai neljä, clavate ascospores (Kuva. 21.2). Bud-vanhemman konjugaatiota on havaittu yhdessä kannassa (Kuva. 21,2 F). Syylät voivat näkyä elektronimikroskopialla (Rodrigues de Miranda 1984a) tai eivät (Rodrigues de Miranda 1979). Ascosporet vapautuvat asceista pian muodostumisensa jälkeen. Joissakin risteissä muodostuu pallomaisia tai soikeita ascosporeja (viikuna. 21,2 D). Runsas itiöemä tapahtuu 2-4 päivää 17-25°C: n lämpötilassa sen jälkeen, kun on sekoitettu yhteensopivien parittelutyyppien viljelmiä 1%: n mallasuuteagariin tai YCBAS-agariin. Lähes kaikki isolaatit ovat hedelmällisiä.
Kuva 21.2. Clavispora lusitaniae. A) SUB 79-257.1×CBS 4413. B) Konjugaatioputket ja C) tsygootti CBS 6936×UWOPS 94-252.1. D) soikeat ascospores, G90-244.1×G90-207.5. Automictic kanta MTCC 1001, E) konjugoitu ascus; F) autogamous ascus; G) deliquesced asci ja agglutinated ascospores. Bar=5 µm. Lachance ym. (2003c), uusintapainos luvalla.
Fermentation
| Glucose | + |
| Galactose | v |
| Sucrose | v |
| Maltose | v |
| Lactose | − |
| Raffinose | − |
| Trehalose | v |
Growth (on Agar Media)
| Glucose | + |
| Inulin | − |
| sakkaroosi | +1 |
| raffinoosi | − |
| Melibioosi | − |
| galaktoosi | v |
| laktoosi | − |
| trehaloosi | + |
| Maltoosi | +1 |
| Meletsitoosi | +1 |
| metyyli-α-d-glukosidi | v |
| liukoinen tärkkelys | − |
| Sellobioosi | v |
| salisiini | +1 |
| l-Sorboosi | + |
| l-Ramnoosi | + |
| d-ksyloosi | + |
| l-arabinoosi | − |
| d-arabinoosi | v |
| d-riboosi | v |
| metanoli | − |
| etanoli | + |
| glyseroli | + |
| erytritoli | − |
| Ribitoli | +1 |
| Galaktitoli | − |
| Mannitol | + |
| Glucitol | +1 |
| myo-Inositol | − |
| dl-Lactate | v |
| Succinate | + |
| Citrate | v |
| d-Gluconate | v |
| d-Glucosamine | v |
| N-Acetyl-d-glucosamine | +1 |
| Hexadecane | v |
| Nitrate | − |
| Vitamin-free | − |
1 harvoin negatiivinen (esim. kanta UWOPS 92-308.1)
Additional Growth Tests and Other Characteristics
| Xylitol | + |
| 2-Keto-d-gluconate | + |
| d-Glucuronate | − |
| Glucono-δ-lactone | v |
| Amino acid-free | + |
| Nitrite | − |
| Ethylamine | + |
| Lysine | + |
| Cadaverine | + |
| 10% NaCl | + |
| 50% Glucose | v |
| Starch production | − |
| DBB | − |
| Gelatin | − |
| Casein | − |
| Tween 80 | v |
| Acid production | − |
| Cycloheximide 0.001% | +/w |
| 1% etikkahappo | − |
| kasvu 30°C: ssa | + |
| kasvu 37°C: ssa | + |
CoQ: 8 (Yamada ja Kondo 1973).
Mol% G+C: 45.1-45.7, viisi kantaa, mukaan lukien CBS 4413 ja CBS 6936 (BD: Lachance et al. 1986).
Geenisekvenssin liittymisnumerot, tyypin kanta: D1 / D2 LSU rRNA=U44817, SSU rRNA=AY497762. Allotyyppi: D1 / D2 LSU rRNA = AY190538.
solujen hiilihydraatit: glukoosi ja mannoosi (Suzuki ja Nakase 1998).
komplementaariset parittelutyypit: CBS 6936, parittelutyyppi h+ ja CBS 4413, parittelutyyppi h -.
tyypin kanta: CBS 6936.
Systematics: Lachance and Phaff (1998a) teki yhteenvedon saatavilla olevista tiedoista l-ramnoosin, sitruunahapon ja maltoosin assimilaation vaihtelevuudesta lajeilla. Isolaatti murskatusta agaavesta, UWOPS92-308.1, jonka jäsenyys lajissa vahvistettiin äskettäin (Lachance et al. 2003c), ei assimiloinut sakkaroosia, α-glukosideja, β-glukosideja, ribitolia, glukono-δ-laktonia eikä N-asetyyliglukosamiinia. Kasvuominaisuuksiin perustuva tunnistaminen on siksi epäluotettavaa. Lähes kaikissa tapauksissa C. lusitaniae eristetään haploidisina kantoina, jotka lisääntyvät suvullisesti vasta sekoitettuaan yhteensopivan parittelutyypin kanssa. Nämä kaksi parittelutyyppiä näyttävät jakautuvan luonnossa tasaisesti. Kanta MTCC 1001 on ainutlaatuinen kyky muodostaa asci omasta, sekoitus isogamous ja bud-vanhemman konjugaatio. Lajin kuulumista tukee D1/D2-sekvenssi, joka on identtinen allotyypin kanssa. Automiktisen kannan löytymisestä huolimatta C. lusitaniae-bakteerin morfologinen tunnistaminen onnistuu kätevimmin parittelemalla tuntemattomia kantoja tunnettujen parittelutyyppien kanssa (François et al. 2001). Valitettavasti allotyyppi, CBS 4413, pariutuu huonosti. François ym. (2001)ja Lachance et al. (2003c) esittäkää luettelot eri kannoista ja niiden pariutumistehokkuudesta.
laji on hämmästyttävän polymorfinen suurissa alayksiköissä rDNA-sekvensseissä, jotka voivat vaihdella yli 30 substituutiolla D2-alueella(Lachance et al. 2003c). Kyky muodostaa sukukypsiä asceja parittelemalla pareja ei kuitenkaan korreloi niiden sekvenssierojen laajuuden kanssa. Jotkin haploidiset kannat ovat heterogeenisiä muunnossekvensseille, mikä osoittaa, että tämä on harvinainen tapaus, jossa laji on olennaisesti polymorfinen tälle normaalisti säilyneelle merkkiaineelle. Miten tällainen polymorfismi syntyi, ei ole selvää. Uskottava selitys on, että laji oli allopatraalisesti jakautunut kahdeksi erilliseksi populaatioksi riittävän pitkäksi ajaksi, jotta divergenssi olisi voinut tapahtua, mutta ilman postzygoottisen isolaatiomekanismin kehittymistä. Populaatioiden yhdistyminen, mahdollisesti mannerliikuntojen kautta, olisi silloin mahdollistanut sekvenssivarianttien rinnakkaiselon yhdessä Mendeliläisessä populaatiossa.
ekologia: C. lusitaniae-lajin ekologinen lokero on huonosti määritelty. Vaikka hiivaa esiintyy kaktuksissa, sitä ei voida pitää kaktofiilisena, sillä sitä on raportoitu vain satunnaisesti lähes 2000 näytteessä (Starmer et al. 1990). Useita kantoja löydettiin nekroottisesta Kaktuskudoksesta Antigualta P. F. Ganterin toimesta. On kiinnostavaa, että nämä näytteet eivät tuottaneet lainkaan C. opuntiae-bakteeria, kuten normaalisti olisi odotettavissa kyseisestä elinympäristöstä. Tequilan tuotantoa varten viljeltyyn agaaveen liittyviä hiivoja koskevassa tutkimuksessa Lachance (1993b) totesi C. lusitaniae-kasvin olevan runsain laji etikkamädässä tämän kasvin lehtien tyvellä.
bioteknologia: tuntematon
maatalous ja elintarvikkeet: tuntematon
kliininen merkitys: Clavispora lusitaniae otetaan säännöllisesti talteen kliinisistä näytteistä, mutta sitä ei pidetä varsinaisena ihmisen patogeenina (Hurley et al. 1987). Se oli ensimmäinen tunnustettu opportunistinen tarttuva organismi holzschu et al. (1979), ja on sittemmin ilmaantunut yli 100 näytettä potilaista, jotka kärsivät immuunipuutoksista (Gargiya et al. 1990). Tutkimus 35 kliinisestä isolaatista (Merz et al. 1992) paljasti, että kromosomikooissa esiintyy huomattavaa vaihtelua kloonista klooniin. Nämä kannat voitiin jakaa sähkökaryotyyppiensä perusteella 15 ryhmään, jotka vastasivat niitä 15 potilasta, joilta ne oli eristetty.