Admixture mapping on geenikartoitusmenetelmä, jossa käytetään sekamuotoista populaatiota (admixture population) etsimään geneettisiä lokuksia, jotka edistävät eri esivanhempien populaatioiden välisiä eroja sairauksissa tai muissa fenotyypeissä. Menetelmää sovelletaan parhaiten populaatioihin, joihin on äskettäin sekoittunut kaksi populaatiota, jotka olivat aiemmin geneettisesti eristyksissä kymmeniä tuhansia vuosia, kuten afroamerikkalaiset ja eurooppalaiset amerikkalaiset (afrikkalaisten ja eurooppalaisten populaatioiden sekoittuminen). Menetelmä pyrkii korreloimaan geneettisen lokuksen lähellä olevan esi-isyyden asteen kiinnostavan fenotyypin tai sairauden kanssa. Perimässä tarvitaan geenimerkkejä, joiden esiintymistiheys vaihtelee eri kantapopulaatioiden välillä.
Admixture-kartoitus perustuu olettamukseen, että erot taudin esiintyvyydessä tai fenotyypeissä johtuvat osittain eroista tautia aiheuttavien tai fenotyyppiä aiheuttavien geenivarianttien esiintymistiheydessä populaatioiden välillä. Sekoittuneessa populaatiossa näitä kausaalisia variantteja esiintyy useammin yhdestä tai toisesta esi-isäpopulaatiosta periytyvissä kromosomisegmenteissä. Ensimmäiset admixture-kuvaukset julkaistiin vuonna 2005, ja sen jälkeen on kartoitettu geneettisiä tekijöitä erilaisiin sairauksiin ja piirteiden eroihin. Näitä ovat esimerkiksi afroamerikkalaisten kohonnut verenpaine, MS-tauti, BMI ja eturauhassyöpä. Vuoteen 2010 mennessä afroamerikkalaisille, latinoille/latinoille ja uiguureille oli rakennettu tiheät kartoituspaneelit.