Le Pen piti Britannian Brexit-äänestystä kesäkuussa 2016 ja Donald Trumpin valintaa Yhdysvaltain presidentiksi marraskuussa 2016 todisteena periaatteidensa kasvavasta hyväksymisestä. Trump oli kampanjoinut laajasti maahanmuuttovastaisella, maahanmuuttovastaisella ja Islaminvastaisella alustalla, ja hänen menestyksensä keskiluokan ja maaseudun äänestäjien keskuudessa näytti enteilevän Le Penille hyvää ennen Ranskan vuoden 2017 presidentinvaaleja. Huhtikuuta 2017 Le Pen sijoittui Hollanden aikana valtiovarainministerinä toimineen EU-myönteisen keskustalaisen Emmanuel Macronin jälkeen presidentinvaalien ensimmäisellä kierroksella toiseksi.
vain päiviä ennen toista kierrosta hakkerit julkaisivat kymmeniätuhansia Macronin kampanjan sisäisiä sähköposteja, joita kuvailtiin ”massiiviseksi ja koordinoiduksi” yritykseksi häiritä vaaleja. Kyberturvallisuusfirmat yhdistivät iskun samaan Venäjän hallitukseen kytköksissä olevaan ryhmään, joka oli ollut vastuussa Yhdysvaltain demokraattipuolueen hakkeroinnista ennen Yhdysvaltain vuoden 2016 presidentinvaaleja. Ranskalaismedian pimennyssäännöt tunteja ennen vaaliuurnien avaamista käytännössä kielsivät kuitenkin raportoinnin tapauksesta, eikä Le Pen saanut tietovuodoista merkittävää hyötyä. Hieman yli 75 prosenttia äänioikeutetuista äänesti toisella kierroksella, mikä on Ranskan alhaisin äänestysprosentti presidentinvaaleissa lähes puoleen vuosisataan. Lisäksi noin neljä miljoonaa äänestäjää—lähes 9 prosenttia vaaliuurnille lähteneistä—päätti heittää tyhjiä tai tahallaan pilattuja äänestyslippuja vastalauseena kummallekin ehdokkaalle. Jäljelle jääneistä äänistä Le Pen sai noin 34 prosenttia äänistä, mikä on lähes kaksinkertainen määrä hänen isänsä Jacques Chiracia vastaan vuoden 2002 vaalien toisella kierroksella.
vaikka hän jäi kauas kakkoseksi Macronille, uhmakas Le Pen julisti kansallisen rintaman tulleen Macronin johtaman hallituksen viralliseksi oppositiopuolueeksi. Väite osoittautui kaikkea muuta kuin todeksi, kun parlamenttivaalit pidettiin kesäkuussa 2017. Kansallinen rintama nappasi vain kahdeksan paikkaa, huomattavasti vähemmän kuin puolueen oli ennakoitu voittavan. Le Pen itse voitti ensimmäistä kertaa parlamenttipaikan edustaessaan Hénin-Beaumontia. Voitto merkitsi sitä, että Le Pen joutui eroamaan Europarlamenttipaikasta, jota hän oli pitänyt hallussaan vuodesta 2004. Vain kaksi viikkoa eroamisensa jälkeen Ranskan viranomaiset asettivat hänet rikostutkintaan varojen väärinkäytöstä hänen toimiessaan Euroopan parlamentin jäsenenä. Euroopan petostentorjuntavirasto, jota syytetään EU: n varoihin liittyvien talousrikosten ja korruption tutkinnasta, väitti Le Penin käyttäneen väärin noin 5 miljoonaa euroa (5,4 miljoonaa euroa) Kansallisen rintaman puoluetoimintaan.