La cartographie des mélanges est une méthode de cartographie génétique qui utilise une population d’ascendance mixte (une population mélangée) pour trouver les loci génétiques qui contribuent aux différences de maladies ou d’autres phénotypes trouvés entre les différentes populations ancestrales. La méthode est mieux appliquée aux populations avec un mélange récent de deux populations précédemment isolées génétiquement pendant des dizaines de milliers d’années, telles que les Afro-Américains et les Américains européens (mélange de populations africaines et européennes). La méthode tente de corréler le degré d’ascendance près d’un locus génétique avec le phénotype ou la maladie d’intérêt. Des marqueurs génétiques dont la fréquence diffère entre les populations ancestrales sont nécessaires à travers le génome.
La cartographie des mélanges est basée sur l’hypothèse que les différences dans les taux de maladies ou les phénotypes sont dues en partie aux différences dans les fréquences des variants génétiques pathogènes ou phénotypiques entre les populations. Dans une population mixte, ces variantes causales se produisent plus fréquemment sur des segments chromosomiques hérités de l’une ou l’autre population ancestrale. Les premières analyses de mélange ont été publiées en 2005 et depuis lors, les contributeurs génétiques à une variété de maladies et de différences de traits ont été cartographiés. Ceux-ci incluent l’hypertension, la sclérose en plaques, l’IMC et le cancer de la prostate chez les Afro-Américains. En 2010, des panneaux cartographiques à haute densité avaient été construits pour les Afro-Américains, les Latinos / Hispaniques et les Ouïghours.