Un leader del movimento indipendentista, è nato a Valladolid, Michoacán. Dal 1779 al 1790, lavorò presso la fattoria di canna da zucchero di Tahuejo ad Apatzingán, forse come impiegato o contabile. Nel 1790 entrò nel Collegio San Nicolás Obispo di Valladolid, dove studiò grammatica latina, retorica, filosofia ed etica. Nel 1795, presso il Seminario Tridentino della stessa città, studiò teologia morale e filosofia. Il 28 aprile, Morelos si recò a Città del Messico per sostenere gli esami per un bachelor of arts presso l’Università Reale e Pontificia. Il 13 dicembre ricevette la prima tosatura e i quattro ordini minori di Valladolid e sei giorni dopo divenne diacono. All’inizio del 1796, si trasferì a Uruapan come sacerdote ausiliario e diresse l’insegnamento della grammatica e della retorica. Nel settembre dello stesso anno fu ordinato diacono a Valladolid e il 21 dicembre 1779 fu ordinato sacerdote nella stessa città.
All’inizio di ottobre 1810, Morelos udì la notizia della rivolta di Hidalgo e il diciannovesimo di quel mese partì per trovarlo. Ha raggiunto Hidalgo il giorno dopo e ha parlato con lui a Charo e Indaparapeo. Morelos è stato incaricato di alzare le armi sulla costa meridionale. Il 13 novembre, Morelos e le sue truppe ingaggiarono il nemico per la prima volta, affrontando le forze realiste di Luis Calatayud a El Veladero. Il 17 novembre, Morelos emise un editto che sopprimeva la schiavitù, le caste e i fondi comunitari. Le sue attività preoccuparono il viceré, che mandò Francisco París a combatterlo. París lo ingaggiò l ‘ 8 dicembre a El Veladero ma fu respinto.
Il 3 maggio 1811, Morelos nominò Hermenegildo Galeana come suo luogotenente. Il 26 maggio, Morelos conquistò Tixtla, dove Vicente Guerrero si unì a lui. Fu lì che pubblicò un editto sull’emissione di una valuta nazionale di rame e scrisse a Ignacio López Rayón sulla formazione di un consiglio per l’insurrezione. Il 18 dicembre, Mariano Matamoros si unì a lui, e il 18 febbraio 1812, Morelos quasi cadde nelle mani di Calleja a Cuautla. Il 10 agosto Morelos arrivò a Tehuacán, dove riorganizzò e addestrò le sue truppe e prese il controllo del movimento ribelle. Nel settembre dello stesso anno, ha nominato Matamoros come secondo in comando e Galeana come maresciallo.
Il 18 ottobre Porlier e Luis del Águila sconfissero Morelos a Ojo de Agua. Conquistò Orizaba il ventinovesimo, ma al suo ritorno a Tehuacán, Luis del Águila lo sconfisse nuovamente a Puente Colorado sulle creste di Acutzingo. Morelos prese Oaxaca il 25 novembre e lì iniziò la pubblicazione del giornale Sud. Il 12 aprile 1813, prese Acapulco e il 31 agosto si diresse a Chilpancingo, dove il 14 settembre aprì il Congresso con l’elezione dei deputati e la lettura dei suoi Sentimientos de la Nación (Sentimenti della Nazione). Il giorno seguente, il Congresso lo elesse Comandante supremo responsabile del ramo esecutivo e il 6 novembre emise il suo Atto di Indipendenza.
Il 23 dicembre Ciriaco de Llano e Agustín de Iturbide cacciarono Morelos dalle colline di Santa María. Si ritirò a Chupío e Puruarán, dove subì un’altra sconfitta. A Tlacotepec, il Congresso lo destituì come Comandante Supremo. Ha subito un’altra sconfitta a LasimImas. In seguito marciò su Tecpan e Acapulco, e il Congresso lo rimosse dal ramo esecutivo il 14 marzo 1814. L ‘ 11 ottobre Morelos incontrò José María Cos a Santa Clara del Cobre. Continuò ad Ario, inseguito dai realisti, e arrivò ad Apatzingán, dove il Congresso pubblicò il suo Decreto costituzionale per la libertà dell’America messicana.
Il Congresso decise di trasferirsi a Tehuacán a causa della ricerca monarchica, e Morelos prese il comando di tenerla. Il 28 settembre 1815 partì per Huetamo, Cutzamala e Tlachapa e il 2 novembre arrivò ad Atenango del Río. Il giorno dopo arrivò a Temalaca e il quinto, mentre si stava dirigendo verso Pilcaya, fu attaccato da Concha e fatto prigioniero da Matías Carrasco, un ex insorto. Arrivò a Città del Messico il ventiduesimo e il ventisettesimo fu dichiarato eretico e retrocesso di grado. Il 20 dicembre Calleja lo condannò a morte. Morelos è stato girato a San Cristóbal Ecatepec.
Nel 1828, la città dove nacque Morelos ricevette il nome di Morelia. Nel 1869, Benito Juárez decretò la fondazione dello stato che porta il suo nome. Il 16 settembre 1925, i suoi resti furono portati alla Colonna dell’Indipendenza.