Dopo un focolaio di una forma mutata di rabbia che si diffonde dagli animali agli esseri umani, oltre 7 miliardi di esseri umani sono morti o infetti. Le persone che vengono morse diventano rabbiose in 90 secondi. Morgan era in macchina con sua moglie Janet quando sono stati attaccati. Era infetto, ma rimase umano con la capacità di parlare con gli infetti.
Ora con un folto gruppo di civili, scienziati del CDC e militari statunitensi in una base nucleare sotterranea, Morgan e il virologo Dr. Gina Rose porta gli infetti e li interroga, sperando di trovare il Paziente Zero e escogitare una cura. Gina lotta con le tensioni tra se stessa, Morgan, e il colonnello Knox, aggravata da Knox essere attratto da Gina, mentre lei è attualmente intimo con Morgan. Mentre interroga un infetto, che Morgan ha chiamato Joe Cocker, Knox spara al paziente.
Avvicinandosi alla ricerca del Paziente Zero, Morgan visita Janet, che è in gabbia nella base sotterranea. Lei è in trattamento con un trattamento sperimentale derivato dal sangue di Morgan. In un flashback, Morgan voleva avere figli con sua moglie, mentre lei non ne voleva.
Gina viene mostrata con un test di gravidanza positivo. I corpi dei soldati caduti vengono cremati quando si aprono gli occhi e si attaccano gli operai e i soldati. È sottomesso e chiede di parlare con Morgan, che è sorpreso che il paziente non sia influenzato dalla musica che ha spinto l’altro infetto in una rabbia. Il team presume che sia strettamente legato al Paziente Zero. Il paziente rivela che era un professore e la sua scuola è stata attaccata dagli infetti. È stato morso, ma mantiene ancora la maggior parte delle sue capacità umane. Il professore dice a Morgan che gli infetti sono esseri umani evoluti, una specie più avanzata che si trova in cima alla catena alimentare in rapida diminuzione. Morgan scopre che un altro dei pazienti, che Morgan aveva chiamato Pete Townshend, ha un trasmettitore all’interno del suo petto, rivelando che l’infetto ha teso una trappola per imparare dove si trova la base.
Lo sciame infetto all’interno, uccidendo o infettando tutti gli esseri umani. Knox spara al suo comandante in modo che gli infetti siano rallentati abbastanza a lungo per lui e Gina per arrivare all’ascensore. Lei afferra la sua pistola e gli dice che è un mostro per farlo. Cerca di dirle che voleva salvarle la vita. Cominciano a litigare e la pistola si spegne, uccidendo Knox. Gina va nelle celle dove sono tenuti gli infetti e trova Morgan che rilascia Janet. Gina lo supplica di lasciare Janet poiché i trattamenti funzionano ma solo per un breve periodo di tempo, ma lui rifiuta. Si intrufolano nel laboratorio di Gina, recuperano i suoi campioni e strisciano attraverso le prese d’aria. Incontrano un topo da laboratorio infetto, che Janet uccide prima che possa arrivare a Gina. Arrivano al parcheggio appena sotto il livello del suolo.
Il Professore li affronta e spiega che è venuto alla base per uccidere Morgan. Morgan è il loro “Paziente Zero” ed è una minaccia per la loro sopravvivenza. Combattono e il professore inizia a chiamare altri infetti, fino a quando Morgan lo impala su un tubo. Il trio fuggire fino Janet dice loro di correre e lei li compra tempo, dicendo Morgan deve lasciarla per salvare il bambino, come ha intuito che Gina è incinta. Questo distrae Morgan abbastanza a lungo da permettere a Janet di chiudere una pesante porta del caveau giusto in tempo per fermare l’orda. Attraverso una finestra nella porta, Janet si asciuga una lacrima dal viso, indicando che ora era in grado di piangere e che il trattamento stava funzionando e ripristinando la sua umanità, e bocche “Ti amo”.
Morgan e Gina seguono il tunnel verso il bosco e trovano una moto. Vanno via nella notte con Morgan che capisce che deve fare tutto il necessario per prendersi cura del loro bambino e salvare qualche residuo della razza umana.