混和マッピングは、混合された祖先の集団（混合された集団）を使用して、異なる祖先集団間で見つかった疾患または他の表現型の違いに寄与する遺伝的遺伝子座を見つける遺伝子マッピングの方法です。 この方法は、アフリカ系アメリカ人やヨーロッパ系アメリカ人（アフリカ系アメリカ人とヨーロッパ系アメリカ人の混和）など、数万年前から遺伝的に単離されていた二つの集団からの最近の混和を持つ集団に最もよく適用される。 この方法は、遺伝子座の近くの祖先の程度を、関心のある表現型または疾患と相関させることを試みる。 先祖の集団間で頻度が異なる遺伝子マーカーは、ゲノム全体で必要とされている。
混和マッピングは、疾患率または表現型の違いは、集団間の疾患を引き起こすまたは表現型を引き起こす遺伝的変異体の頻度の違いに部分的に起因するという仮定に基づいている。 混合された集団では、これらの原因変異体は、1つまたは別の祖先集団から継承された染色体セグメントでより頻繁に発生する。 最初の混和スキャンは2005年に出版され、それ以来いろいろな病気および特性の相違への遺伝の貢献者は地図を描かれました。 これらには、アフリカ系アメリカ人の高血圧、多発性硬化症、BMI、および前立腺癌が含まれます。 2010年までに、アフリカ系アメリカ人、ラテン系/ヒスパニック系、ウイグル族のための高密度マッピングパネルが構築されていた。