1 Introduksjon
selv om medlemmer Av Ascomycota rekke, spesielt Sacchromyces cerevisiae, er de mest studerte sopp, er det 80.000 kjente arter Av Sopp rike. Det er mye mangfold i riket, alt fra liten ufarlig unicellular gjær Som S. cerevisiae til det store plantepatogenet Armillaria ostoyae, en av de største organismene i verden. Denne sistnevnte arten er medlem Av Basidiomycota phylum, en rekke mindre godt forstått Enn Ascomycota.
selv om ingen basidiomycete-arter har blitt studert så detaljert Som S. cerevisiae, er den en fascinerende og mangfoldig gruppe organismer. Basidiomycetene produserer mange interessante sekundære metabolitter som brukes i medisin, industri og forskning. Medlemmer av phylum står for ca 10% (40 arter) av kjente humane sopppatogener (Morrow og Fraser, 2009). MED UTBRUDDET AV AIDS-epidemien har en basidiomycete spesielt Cryptococcus neoformans steget fra et lite kjent patogen til en av de beste soppdreperne av immunkompromitterte pasienter.
c. neoformans er primært funnet som en haploid gjær, og er mye til stede i miljøet over hele verden, inkludert i fugle excreta, jord og trebark. Studier har vist at mennesker kommer i hyppig kontakt Med c. neoformans: personer uten kryptokokkose har antistoffer mot gjæren(Chen et al ., 1999), og de fleste barn ser ut til å ha blitt utsatt i en alder av fem (Goldman et al., 2001). Dette antyder at flertallet av individer møter C. neoformans i miljøet, mest sannsynlig gjennom innånding i lungene. Immunokompetente individer er vanligvis i stand til å kontrollere og inneholde infeksjonen, noe som ofte fører til en asymptomatisk latent infeksjonstilstand. Hvis pasientens immunsystem blir kompromittert på et senere tidspunkt, kan latent infeksjon reaktivere. I tilfelle av den immunkompromitterte personen kan lungeinfeksjon føre til lungebetennelse etterfulgt av spredning via blodbanen til andre organer. C. neoformans er en av bare noen få sopparter som er kjent for å krysse blod-hjernebarrieren og infisere hjernen (Kim, 2006), noe som fører til meningitt som er dødelig hvis den ikke behandles. DA AIDS-epidemien begynte på 1980-tallet, var det en samtidig økning i kryptokokker tilfeller over hele verden. I de senere år har økt bruk av antiretroviral terapi og antifungals redusert den totale forekomsten av dødelig kryptokokkmeningitt. Men I områder hvor tilgangen til behandling er begrenset, Er c. neoformans fortsatt en viktig bekymring i omsorgen for immunkompromitterte, inkludert AIDS, kreft og organtransplanterte pasienter. I tillegg nylige utbrudd av cryptococcosis i immunkompetente individer I Pacific Northwest heve bekymringer om risikoen for cryptococcal infeksjon selv i ellers friske individer (Bartlett et al ., 2008; Hoang et al., 2004).
Som en haploid gjærcelle er C. neoformans mottagelig for mange av de omfattende protokollene som er utviklet For S. cerevisiae, krever i de fleste tilfeller bare noen få justeringer. Men etter å ha divergert fra ascomycete-linjen for 400 millioner år siden (Mya) (Taylor Og Berbee, 2006), er det betydelige forskjeller i cellulær maskineri og livssyklus (se nedenfor). Comparative genomics lover å gi rik informasjon om utviklingen av delte og divergerte gener, proteiner og veier, samt gi innsikt i forskjellene mellom arter som tillater en gjær å eksistere som en godartet saprofyt og en annen for å forårsake dødelig infeksjon i en pattedyrsvert.