Da Middelhavet var en varm tørr hul nær slutten Av Messinian Saltholdighetskrisen i slutten Av Miocen, Var Faiyum en tørr hul, Og Nilen flød forbi den på bunnen av en canyon (som var 8000 fot (2400 m) dyp eller mer Der Kairo er i Dag). Etter Middelhavet reflooded på slutten Av Miocen, Nilen canyon ble en arm av havet nå innlandet lenger Enn Aswan. I løpet av geologisk tid ble sjøarmen gradvis fylt med silt og Ble Nildalen.
Til Slutt siltet nildalen opp høyt nok til å la Nilen periodisk flyte over I Faiyum-Hulen og lage en innsjø i Den. Innsjøen er først nedtegnet fra rundt 3000 F. KR., rundt Tiden Til Menes (Narmer). Men for det meste ville det bare bli fylt med høyt flomvann. Innsjøen ble avgrenset av neolittiske bosetninger, og Byen Crocodilopolis vokste opp i sør hvor høyere bakken opprettet en ås.
i 2300 f. KR. ble vannveien fra Nilen til den naturlige innsjøen utvidet og utdypet for å lage en kanal som nå er Kjent Som Bahr Yussef. Denne kanalen matet inn i sjøen. Dette var ment å tjene tre formål: kontrollere oversvømmelsen Av Nilen, regulere Vannstanden Til Nilen i tørre årstider, og betjene det omkringliggende området med vanning. Det er bevis på at oldtidens egyptiske faraoer fra det tolvte dynasti benyttet den naturlige innsjøen Faiyum som et reservoar for å lagre overskudd av vann for bruk i tørre perioder. De enorme vannverkene som ble utført av oldtidens egyptiske faraoer i det tolvte dynasti for å forvandle innsjøen til et stort vannreservoar ga inntrykk av at innsjøen i seg selv var en kunstig utgravning, som rapportert av klassiske geografer og reisende. Innsjøen ble til slutt forlatt på grunn av at den nærmeste grenen av Nilen minket i størrelse fra 230 F.KR.
Faiyum var kjent for oldtidens Egyptere som Det tjueførste nome I Øvre Egypt, Atef-Pehu («Nordlige Sycamore»). I oldtidens Egyptiske tid var hovedstaden Sh-d-y-t (vanligvis skrevet «Shedyt»), kalt Av Grekerne Krokodilopolis, og grunnlagt av Ptolemaios II Som Arsinoe.
denne regionen har de tidligste bevisene for jordbruk I Egypt, og var et senter for kongelig pyramide og gravbygging i Det Tolvte dynasti I Mellomriket, og igjen under styret Til Ptolemeerdynastiet. Faiyum ble en av brødkurvene i Den Romerske verden.
for de første tre århundrene e. KR. balsamerte folket I Faiyum og andre Steder I Det Romerske Egypt ikke bare sine døde, men plasserte også et portrett av den avdøde over ansiktet til mumiepapirene, likkledet eller saken. Egypterne fortsatte sin praksis med å begrave sine døde, til tross For Den Romerske preferanse for kremasjon. Bevart av tørr ørken miljø, disse Faiyum portretter utgjør den rikeste kroppen av portretter å ha overlevd fra antikken. De gir oss et vindu inn i et bemerkelsesverdig samfunn av folk av blandet opprinnelse—Egyptere, Grekere, Romere, Syrere, Libyere og andre – som blomstret for 2000 år siden I Faiyum. Faiyumportrettene ble malt på tre i en pigmentert voksteknikk kalt encaustic.
i slutten av 1. årtusen e. kr. krympet jordbruksarealet, og bosetninger rundt kanten av bassenget ble forlatt. Disse stedene inkluderer noen av de best bevarte fra Slutten Av Romerriket, særlig Karanis, og Fra Den Bysantinske Og Tidlige Arabiske Perioder, selv om nyere utbygging har sterkt redusert de arkeologiske funksjonene.
«Kolonitype» landsbynavn (landsbyer oppkalt etter byer andre Steder i Egypt og steder utenfor Egypt) viser at mye land ble brakt inn i dyrking I Faiyum i den greske og Romerske perioden.
I Henhold Til Encyclopediaæ Britannica Ellevte Utgave, i 1910 ble over 1000 km2 (400 mile2) Av Faiyum-Oasen dyrket, de viktigste avlingene var korn og bomull. Fullførelsen av Aswan Low Dam sørget for en fyldigere tilførsel av vann, noe som gjorde det mulig for 20 000 hektar (80 km2) land, tidligere unirrigated og untaxed, å bli brakt under dyrking i de tre årene 1903-1905. Tre avlinger ble oppnådd om tjue måneder. Provinsen var kjent for sine fiken og druer av eksepsjonell kvalitet. Oliven ble også dyrket. Rose trær var veldig mange, og det meste Av attar av roser I Egypt ble produsert i provinsen. Faiyum hadde også en utmerket sau av sau.