1 Inleiding
hoewel leden van de Ascomycota phylum, in het bijzonder Sacchromyces cerevisiae, de meest bestudeerde schimmels zijn, zijn er 80.000 bekende soorten van het Schimmelrijk. Er is een grote diversiteit in het Koninkrijk, variërend van kleine onschadelijke eencellige gist zoals S. cerevisiae tot de grote plant pathogeen Armillaria ostoyae, een van de grootste organismen in de wereld. Deze laatste soort is een lid van de Basidiomycota phylum, een phylum minder goed begrepen dan Ascomycota.
hoewel er geen basidiomycete-soorten zo gedetailleerd zijn bestudeerd als S. cerevisiae, is het een fascinerende en diverse groep organismen. Basidiomycetes produceren vele interessante secundaire die metabolites in geneeskunde, de industrie, en onderzoek worden gebruikt. Leden van de phylum zijn goed voor ongeveer 10% (40 soorten) van bekende menselijke schimmelpathogenen (Morrow and Fraser, 2009). Met het begin van de AIDS-epidemie is een basidiomycete in het bijzonder, Cryptococcus neoformans, gestegen van een weinig bekende ziekteverwekker tot een van de top schimmeldoders van immuungecompromitteerde patiënten.
C. neoformans wordt voornamelijk aangetroffen als haploïde gist en komt wereldwijd op grote schaal voor in het milieu, onder meer in vogeluitwerpselen, bodem en boomschors. Studies hebben aangetoond dat mensen in frequent contact komen met C. neoformans: individuen zonder voorgeschiedenis van cryptokokken bezitten antilichamen tegen de gist (Chen et al., 1999), en de meeste kinderen lijken te zijn blootgesteld door de leeftijd van vijf (Goldman et al., 2001). Dit stelt voor dat de meerderheid van individuen C. neoformans in het milieu tegenkomen, hoogstwaarschijnlijk door inademing in de longen. Immunocompetente individuen zijn meestal in staat om de infectie te controleren en te beheersen, vaak leidend tot een asymptomatische latente staat van infectie. Als het immuunsysteem van de patiënt wordt gecompromitteerd op een later tijdstip, kan de latente infectie reactiveren. In het geval van de immuungecompromitteerde individu, longinfectie kan leiden tot longontsteking gevolgd door verspreiding via de bloedbaan naar andere organen. C. neoformans is een van de weinige schimmelsoorten waarvan bekend is dat ze de bloed–hersenbarrière passeren en de hersenen infecteren (Kim, 2006). Toen de AIDS-epidemie begon in de jaren 1980, was er een gelijktijdige stijging van cryptokokken gevallen wereldwijd. In de afgelopen jaren heeft het toegenomen gebruik van antiretrovirale therapie en antischimmelmiddelen de totale incidentie van fatale cryptokokkenmeningitis verminderd. Maar in gebieden waar de toegang tot behandeling beperkt is, blijft C. neoformans een belangrijke zorg in de zorg voor de immuungecompromitteerde, met inbegrip van AIDS, kanker, en orgaantransplantatiepatiënten. Bovendien, recente uitbraken van cryptokokken in immunocompetente individuen in de Pacific Northwest verhogen bezorgdheid over het risico van cryptokokken infectie, zelfs in anderszins gezonde individuen (Bartlett et al., 2008; Hoang et al., 2004).
als haploïde gistcel is C. neoformans vatbaar voor veel van de uitgebreide protocollen die zijn ontwikkeld voor S. cerevisiae, waarvoor in de meeste gevallen slechts enkele aanpassingen nodig zijn. Na ongeveer 400 miljoen jaar geleden af te wijken van de ascomycete-lijn (mya) (Taylor en Berbee, 2006), zijn er echter significante verschillen in de cellulaire machines en de levenscyclus ervan (zie hieronder). Vergelijkende genomica belooft rijke informatie over de evolutie van gedeelde en diverged genen, proteã nen, en wegen op te leveren, evenals het aanbieden van inzicht in de verschillen tussen species die één gist toestaan om als goedaardige saprofyt en een andere te bestaan om dodelijke besmetting in een zoogdiergastheer te veroorzaken.