de actieve vorm DnaA is gebonden aan ATP. Onmiddellijk nadat een cel is verdeeld, is het niveau van actieve DnaA binnen de cel laag. Hoewel de actieve vorm van DnaA ATP vereist, vereist de vorming van de complexe Oric/dnaa en het daaropvolgende afwikkelen van DNA geen ATP-hydrolyse.
de oriC-site in E. coli heeft drie op rijke 13 basenpaar regio ‘s(DUEs) gevolgd door vier 9 BP regio’ s met de sequentie TTAT(C of a)CA (C of a)A. ongeveer 10 DnaA-moleculen binden aan de 9 BP regio ‘ s, die rond de eiwitten wikkelen waardoor het DNA in het At-rijke gebied zich ontspant. Er zijn 8 dnaa-bindingsplaatsen binnen oriC, waaraan DnaA met differentiële affiniteit bindt. Wanneer de replicatie van DNA op het punt staat te beginnen, bezet DnaA alle plaatsen van de hoge en lage affiniteitsband. Het gedenatureerde at-rijke gebied zorgt voor de rekrutering van DnaB (helicase), die complexen met DnaC (helicase loader). Dnac helpt de helicase om aan ssDNA bij het 13 BP-gebied te binden en goed aan te passen; dit wordt bereikt door ATP hydrolyse, waarna DnaC wordt vrijgegeven. De enig-bundel bindende proteã nen (SSBs) stabiliseren de enige bundels van DNA om de replicatiebel te handhaven. DnaB is een 5’→3 ‘ helicase, dus het reist op de achterblijvende streng. Het associeert met DnaG (een primase) om de enige inleiding voor de belangrijke bundel te vormen en om de primers van RNA op de achterblijvende bundel toe te voegen. De interactie tussen DnaG en DnaB is noodzakelijk om de lengtegraad van Okazaki fragmenten op de achterblijvende streng te controleren. De polymerase III van DNA kan dan de replicatie van DNA beginnen.
DnaA bestaat uit vier domeinen: de eerste is de N-terminal die met regelgevende proteã nen associeert, de tweede is een spiraalvormig linkergebied, het derde domein is een gebied van AMERIKAANSE CLUB VAN AUTOMOBILISTEN+ dat aan ATP bindt, en het vierde domein is het C-eind bindend gebied van DNA. DnaA bevat twee behouden gebieden: de eerste wordt gevestigd in het centrale deel van de proteã ne en correspondeert met het ATP-bindende domein, de tweede wordt gevestigd in de C-eindhelft en is betrokken bij DNA-bindende.