“A Milhouse Divided” is de enige aflevering waarvoor Steve Tompkins heeft enige schrijven krediet, hoewel hij was een deel van de schrijvende medewerkers voor een aantal jaren. De schrijvers wilden een aflevering doen waarin een echtpaar ging scheiden. De van Houtens werden gekozen omdat de schrijvers vonden dat zij het meest ontwikkelde koppel waren naast Marge en Homer en de Lovejoys. De scène in de aflevering “Sideshow Bob’ s Last Glimming” waar Milhouse in een jet zit en doet alsof hij raketten afvuurt op zijn ouders is waar ze het idee kregen om het huwelijk van zijn ouders in de problemen te krijgen.Oorspronkelijk was de aflevering ook gericht op de effecten van de scheiding op Milhouse en er was een subplot waarbij Bart jaloers was op Milhouse en wenste dat Marge en Homer ook zouden scheiden. Verschillende scènes werden geschreven en geanimeerd voor de aflevering, maar uiteindelijk werden ze gesneden omdat het script erg lang was. Een soortgelijk idee zou worden gebruikt als plotpunt in de aflevering “Milhouse of Sand and Fog”van seizoen 17. De derde acte van de aflevering verschuift de focus van de van Houtens naar Homer en Marge omdat de schrijvers vonden dat tertiaire personages niet de interesse van het publiek konden dragen voor een hele aflevering. Bill Oakley heeft gezegd dat hij vond dat de aflevering zou hebben gefaald als ze vast te zitten met de van Houtens voor de derde akte en de meeste van de andere schrijvers vonden ook dat het de juiste zet was.Het idee voor het diner kwam van Oakley, die een feestje wilde zoals In “The War of The Simpsons”. Voor de tweede helft van de aflevering, Luann werd opnieuw ontworpen om meer jeugdige kijken en kreeg een nieuwe outfit. Een grote naam zanger werd oorspronkelijk gezocht om te zingen ” Can I Borrow a Feeling?”over de aftiteling. De schrijvers wilden Sheryl Crow, maar ze weigerde en het concept werd later geschrapt.