21.1 Clavispora Lusitaniae Rodrigues de Miranda (1979)
Anamorph: Candida lusitaniae van Uden & do Carmo-Sousa
wzrost na agarze YM: po 3 dniach w temperaturze 25°C komórki są Subglobalne, jajowate do wydłużonych, 2-6×3-10 µm i występują pojedynczo, w parach lub w krótkich łańcuchach. Wzrost maślany, biały do kremowego, błyszczący lub czasami matowy i szorstki.
wzrost bulionu glukozowo-drożdżowego: czasami wzrost może być kłaczkowaty.
Hodowla płytkowa Dalmau na agarze kukurydzianym: po 1 tygodniu w temperaturze 25°C pseudohyfy są obfite i dobrze rozwinięte. Kolonie mogą być otoczone pseudohyphae.
Tworzenie askospor: Asci są zwykle bilobate, zawierające jedną lub dwie, rzadko trzy lub cztery, askospory klawatowe (rys. 21.2). W jednym szczepie zaobserwowano koniugację pączek-rodzic (Fig. 21.2 F). Brodawki mogą (Rodrigues de Miranda 1984a) lub nie mogą (Rodrigues de Miranda 1979) być widoczne przez mikroskopię elektronową. Askospory są uwalniane z asci wkrótce po ich utworzeniu. W niektórych krzyżach powstają kuliste do jajowatych askospory (rys. 21.2 D). Obfite zarodkowanie następuje 2-4 dni w temperaturze 17-25°c po zmieszaniu kultur zgodnych typów krycia na 1% agarze z ekstraktu słodowego lub agarze YCBAS. Prawie wszystkie Izolaty są płodne.
rysunek 21.2. Clavispora lusitaniae. A) SUB 79-257, 1×CBS 4413. B) lampy Koniugacyjne i C) zygota CBS 6936×UWOPS 94-252.1. D) jajowate askospory, G90-244,1×G90-207,5. Szczep Automictic MTCC 1001, (E) skoniugowany ascus; (F) autogamiczny ascus; G) deliquesed asci i aglutynowane askospory. Bar=5 µm. Lachance et al. (2003C), przedruk za zgodą.
Fermentation
| Glucose | + |
| Galactose | v |
| Sucrose | v |
| Maltose | v |
| Lactose | − |
| Raffinose | − |
| Trehalose | v |
Growth (on Agar Media)
| Glucose | + |
| Inulin | − |
| Sucrose | +1 |
| Raffinose | − |
| Melibiose | − |
| Galactose | v |
| Lactose | − |
| Trehalose | + |
| Maltose | +1 |
| Melezitose | +1 |
| Methyl-α-d-glucoside | v |
| Soluble starch | − |
| Cellobiose | v |
| Salicin | +1 |
| l-Sorbose | + |
| l-Rhamnose | + |
| d-Xylose | + |
| l-Arabinose | − |
| d-Arabinose | v |
| d-Ribose | v |
| Astronautics | − |
| Ethanol | + |
| Glycerol | + |
| Erythritol | − |
| Ribitol | +1 |
| Galactitol | − |
| Mannitol | + |
| Glucitol | +1 |
| myo-Inositol | − |
| dl-Lactate | v |
| Succinate | + |
| Citrate | v |
| d-Gluconate | v |
| d-Glucosamine | v |
| N-Acetyl-d-glucosamine | +1 |
| Hexadecane | v |
| Nitrate | − |
| Vitamin-free | − |
1 rzadko negatywne (np. szczep UWOPS 92-308.1)
Additional Growth Tests and Other Characteristics
| Xylitol | + |
| 2-Keto-d-gluconate | + |
| d-Glucuronate | − |
| Glucono-δ-lactone | v |
| Amino acid-free | + |
| Nitrite | − |
| Ethylamine | + |
| Lysine | + |
| Cadaverine | + |
| 10% NaCl | + |
| 50% Glucose | v |
| Starch production | − |
| DBB | − |
| Gelatin | − |
| Casein | − |
| Tween 80 | v |
| Acid production | − |
| Cycloheximide 0.001% | +/w |
| 1% octan | − |
| wzrost w temperaturze 30°C | + |
| wzrost w temperaturze 37°C | + |
CoQ: 8 (Yamada i Kondo 1973).
Mol % G + C: 45,1-45,7, pięć szczepów, w tym CBS 4413 i CBS 6936 (BD: Lachance et al. 1986).
numery sekwencji genów, Szczep typu: D1 / D2 LSU rRNA=U44817, SSU rRNA=AY497762. Allotyp: D1 / D2 LSU rRNA=AY190538.
węglowodany komórkowe: glukoza i mannoza (Suzuki and Nakase 1998).
komplementarne typy krycia: CBS 6936, krycie typu h+ i CBS 4413, krycie typu h -.
Typ szczep: CBS 6936.
Systematyka: Lachance i Phaff (1998a) podsumowali dostępne informacje na temat zmienności spotykanej u gatunków w asymilacji l-ramnozy, kwasu cytrynowego i maltozy. Izolat ze zmiażdżonej agawy UWOPS92-308.1, którego przynależność do gatunku została niedawno potwierdzona (Lachance et al. 2003C), nie przyswajają sacharozy, α-glukozydów, β-glukozydów, rybitolu, glukono-δ-laktonu i N-acetylo-glukozaminy. Identyfikacja oparta na cechach wzrostu jest zatem zawodna. W prawie wszystkich przypadkach C. lusitaniae jest izolowany w postaci haploidalnych szczepów, które ulegają rozmnażaniu płciowemu dopiero po zmieszaniu z kompatybilnym typem godowym. Oba rodzaje kojarzeń wydają się być równomiernie rozmieszczone w przyrodzie. Szczep MTCC 1001 jest unikalny w zdolności do tworzenia asci samodzielnie, przez mieszaninę koniugacji izogamicznej i pączkowo-macierzystej. Przynależność do gatunku jest poparta sekwencją D1/D2, która jest identyczna z sekwencją allotypu. Pomimo odkrycia szczepu automictic, morfologiczną identyfikację C. lusitaniae najłatwiej osiągnąć poprzez kojarzenie nieznanych szczepów ze znanymi typami kojarzeń (François et al. 2001). Niestety, allotyp, CBS 4413, słabo się kojarzy. François et al. (2001) oraz Lachance et al. (2003C) dostarczają wykazów różnych szczepów i ich skuteczności krycia.
gatunek jest zadziwiająco polimorficzny w dużych sekwencjach rDNA podjednostek, które mogą się różnić o ponad 30 podstawień w domenie D2 (Lachance et al. 2003c). Nie ma jednak korelacji między zdolnością do tworzenia dojrzałych asci przez pary godowe a ich zakresem dywergencji sekwencji. Niektóre szczepy haploidalne są niejednorodne dla sekwencji wariantowych, co wskazuje, że jest to rzadki przypadek, w którym gatunek jest zasadniczo polimorficzny dla tego normalnie zachowanego markera. Nie jest jasne, w jaki sposób powstał taki polimorfizm. Prawdopodobnym wyjaśnieniem jest to, że gatunek został allopatrycznie podzielony na dwie odrębne populacje przez wystarczająco długi czas, aby umożliwić rozbieżność, ale bez rozwoju postzygotycznego mechanizmu izolacji. Ponowne zjednoczenie populacji, prawdopodobnie poprzez dryf kontynentalny, pozwoliłoby na współistnienie wariantów sekwencji w jednej populacji Mendla.
Ekologia: nisza ekologiczna C. lusitaniae jest słabo zdefiniowana. Chociaż drożdże występują u kaktusów, nie można ich uznać za kaktofilowe, odnotowano je tylko sporadycznie w prawie 2000 próbkach (Starmer et al. 1990). Kilka szczepów zostało Odzyskanych z tkanki martwiczych kaktusów w Antigui przez P. F. Gantera. Co ciekawe, próbki te nie dały żadnych C. opuntiae, jak można by się spodziewać z tego siedliska. W badaniu drożdży związanych z agawą uprawianą do produkcji tequili Lachance (1993b) stwierdził, że C. lusitaniae jest najliczniejszym gatunkiem w gnidach octowych u podstawy liści tej rośliny.
Biotechnologia: nieznana
Rolnictwo i żywność: nieznana
znaczenie kliniczne: Clavispora lusitaniae jest regularnie odzyskiwana w próbkach klinicznych, ale nie jest uważana za prawdziwy ludzki patogen (Hurley et al. 1987). Po raz pierwszy został uznany za oportunistyczny organizm zakaźny przez Holzschu i wsp. (1979)i od tego czasu pojawił się w ponad 100 okazach od pacjentów cierpiących na niedobory odporności (Gargeya et al. 1990). Badanie 35 izolatów klinicznych (Merz i wsp . 1992) ujawnił, że znaczna ilość różnic w rozmiarach chromosomów występuje od klonu do klonu. Szczepy te można przypisać, na podstawie ich elektrokaryotypów, do 15 grup odpowiadających 15 pacjentom, z których zostały wyizolowane.