glikogen: glikogen jest najczęstszą formą glukozy u zwierząt i jest szczególnie obfity w komórkach mięśni i wątroby. Pojawia się w mikrografie elektronowym jako klastry lub rozeta cząstek beta, które przypominają rybosomy, znajdujące się w pobliżu gładkiego retikulum endoplazmatycznego. Glikogen jest ważnym źródłem energii komórki, dlatego będzie dostępny na żądanie. Enzymy odpowiedzialne za glikogenolizę rozkładają glikogen na pojedyncze cząsteczki glukozy i mogą być wykorzystywane przez wiele narządów organizmu.
lipidy: lipidy są trójglicerydami w postaci magazynowania jest powszechną formą inkluzji, nie tylko są przechowywane w wyspecjalizowanych komórkach (adipocytach), ale także znajdują się jako krople w różnych typach komórek, zwłaszcza hepatocytach. Są to płyny w temperaturze ciała i pojawiają się w żywych komórkach jako załamane kuliste krople. Lipid daje ponad dwa razy więcej kalorii na gram niż węglowodany. Na żądanie służą jako lokalny magazyn energii i potencjalne źródło krótkich łańcuchów węglowych, które są wykorzystywane przez komórkę w syntezie błon i innych lipidów zawierających składniki strukturalne lub produkty wydzielnicze.
kryształy: inkluzje krystaliczne od dawna są uznawane za normalne składniki niektórych typów komórek, takich jak komórki Sertoliego i komórki Leydiga ludzkich jąder, a czasami w makrofagach. Uważa się, że struktury te są krystalicznymi formami niektórych białek, które znajdują się wszędzie w komórce, takich jak jądro, mitochondria, retikulum endoplazmatyczne, ciało Golgiego i wolne w macierzy cytoplazmatycznej.
Pigmenty: najczęstszym pigmentem w organizmie, oprócz hemoglobiny czerwonych krwinek, jest melanina, wytwarzana przez melanocyty skóry i włosów, komórki barwnikowe siatkówki i wyspecjalizowane komórki nerwowe w istocie czarnej mózgu. Pigmenty te pełnią funkcje ochronne w skórze i wspomagają zmysł wzroku w siatkówce, ale ich funkcje w neuronach nie są w pełni zrozumiałe. Ponadto, tkanka serca i neurony ośrodkowego układu nerwowego wykazują żółty do brązowego pigment zwany lipofuscyną, niektórzy uważają, że mają aktywność lizosomalną.