kleszczowe zapalenie mózgu (TBE) jest wirusową chorobą zakaźną człowieka obejmującą ośrodkowy układ nerwowy. TBE jest wywoływany przez kleszczowego wirusa zapalenia mózgu (tbev), członka rodziny Flaviviridae, i został początkowo wyizolowany w 1937 roku. Opisano trzy podtypy wirusa: Europejski lub Zachodni wirus kleszczowego zapalenia mózgu, syberyjski wirus kleszczowego zapalenia mózgu i Dalekowschodni wirus kleszczowego zapalenia mózgu (dawniej znany jako Russian Spring Summer encephalitis virus, RSSEV).
rodzina Flaviviridae obejmuje kilka wirusów przenoszonych przez kleszcze atakujących ludzi. Wirusy te są blisko spokrewnione z TBEV i dalekowschodnim TBE i obejmują wirus gorączki krwotocznej Omsk na Syberii, wirus choroby lasu Kyasanur w Indiach i jego bliski krewny, wirus Alkhurma w Arabii Saudyjskiej. Wirus Louping ill (Wielka Brytania) jest również członkiem tej rodziny; powoduje chorobę głównie u owiec i został zgłoszony jako przyczyna choroby podobnej do TBE u pracowników laboratoryjnych i osób mających kontakt z chorymi owcami (np. weterynarze, rzeźnicy). W USA i Rosji inny flawiwirus kleszczowy, wirus Powassan, jest odpowiedzialny za zapalenie mózgu u ludzi.