1 Introducere
deși membrii filumului Ascomycota, în special Sacchromyces cerevisiae, sunt cele mai studiate ciuperci, există 80.000 de specii cunoscute ale Regatului ciupercilor. Există o mare diversitate în regat, variind de la mici drojdii unicelulare inofensive, cum ar fi S. cerevisiae, până la marele agent patogen al plantei Armillaria ostoyae, unul dintre cele mai mari organisme din lume. Această din urmă specie este un membru al Basidiomycota filum, un filum mai puțin bine înțeles decât Ascomycota.
deși nicio specie de basidiomicet nu a fost studiată la fel de detaliat ca S. cerevisiae, este un grup fascinant și divers de organisme. Basidiomicetele produc mulți metaboliți secundari interesanți utilizați în medicină, industrie și cercetare. Membrii filului reprezintă aproximativ 10% (40 de specii) de agenți patogeni fungici umani cunoscuți (Morrow și Fraser, 2009). Odată cu debutul epidemiei de SIDA, un basidiomicet în special, Cryptococcus neoformans, a crescut de la un agent patogen puțin cunoscut la unul dintre ucigașii fungici de top ai pacienților imunocompromiși.
C. neoformans se găsește în principal ca drojdie haploidă și este prezent pe scară largă în mediul înconjurător la nivel mondial, inclusiv în excrementele aviare, sol și scoarța copacilor. Studiile au arătat că oamenii intră în contact frecvent cu C. neoformans: persoanele fără antecedente de criptococoză posedă anticorpi împotriva drojdiei (Chen și colab., 1999), iar majoritatea copiilor par să fi fost expuși până la vârsta de cinci ani (Goldman și colab., 2001). Acest lucru sugerează că majoritatea indivizilor întâlnesc C. neoformans în mediu, cel mai probabil prin inhalare în plămâni. Persoanele imunocompetente sunt de obicei capabile să controleze și să conțină infecția, ducând adesea la o stare latentă asimptomatică a infecției. Dacă sistemul imunitar al pacientului devine compromis la o dată ulterioară, infecția latentă se poate reactiva. În cazul individului imunocompromis, infecția pulmonară poate duce la pneumonie urmată de diseminarea prin sânge către alte organe. C. neoformans este una dintre puținele specii fungice despre care se știe că traversează bariera hemato–encefalică și infectează creierul (Kim, 2006), ducând la meningită care este fatală dacă este lăsată netratată. Când epidemia de SIDA a început în anii 1980, a existat o creștere concomitentă a cazurilor de criptococoză la nivel mondial. În ultimii ani, utilizarea crescută a terapiei antiretrovirale și a antifungicelor a redus incidența generală a meningitei criptococice fatale. Cu toate acestea, în zonele în care accesul la tratament este limitat, C. neoformans rămâne o preocupare importantă în îngrijirea pacienților imunocompromiși, inclusiv a pacienților cu SIDA, cancer și transplant de organe. În plus, focarele recente de criptococoză la persoanele imunocompetente din nord-vestul Pacificului ridică îngrijorări cu privire la riscul de infecție criptococică chiar și la persoanele altfel sănătoase (Bartlett și colab., 2008; Hoang și colab., 2004).
ca celulă de drojdie haploidă, C. neoformans este susceptibilă la multe dintre protocoalele extinse care au fost dezvoltate pentru S. cerevisiae, necesitând în majoritatea cazurilor doar câteva ajustări. Cu toate acestea, după ce s-a abătut de la descendența ascomicetului cu aproximativ 400 de milioane de ani în urmă (Mya) (Taylor și Berbee, 2006), există diferențe semnificative în ceea ce privește mașinile sale celulare și ciclul de viață (vezi mai jos). Genomica comparativă promite să ofere informații bogate despre evoluția genelor, proteinelor și căilor comune și divergente, precum și să ofere o perspectivă asupra diferențelor dintre specii care permit ca o drojdie să existe ca saprofit benign și alta să provoace infecții letale la o gazdă de mamifere.