la 1 ianuarie 1918, 12 studenți din patru state s-au întâlnit cu Nora Chambers într-o cameră de la etaj a Bisericii lui Dumnezeu Editura Din Cleveland, Tennessee. Această întâlnire de primă clasă A școlii de instruire biblică a Bisericii lui Dumnezeu (BTS) a dus la fondarea Universității Lee. Inițial, Chambers a servit ca singurul membru al Facultății, iar cei zeci de studenți au alcătuit întregul corp Studențesc. Primii doi absolvenți și-au câștigat diplomele în aprilie 1919, iar în septembrie 1919 a fost inițiat un program de corespondență, care a mărit înscrierea generală a școlii la 788 de elevi. În deceniile următoare, BTS și-a extins facultatea și curriculum-ul și s-a mutat într-un campus din Sevierville în 1938.
în 1947 BTS s-a mutat înapoi în Cleveland, a ocupat un campus mai mare cumpărat recent și a fost numit Lee College în onoarea lui Flavius J. Lee, un lider timpuriu în denominație și al doilea președinte al școlii. Colegiul și-a extins accentul pentru a include atât studii biblice, cât și arte liberale tradiționale într-un curriculum de patru ani. În 1959 Lee ‘ s Bible College a fost acreditat de Asociația de Acreditare a Colegiilor biblice, iar în 1960, un colegiu junior a fost acreditat de Asociația sudică a Colegiilor și școlilor (SACS). În 1969 SACS i-a acordat lui Lee acreditarea completă ca colegiu de arte liberale de patru ani. Din anii 1970 până la începutul anilor 1990, Lee a cunoscut o creștere extraordinară, sporindu-și înscrierea la peste 2.600 de studenți, făcându-l unul dintre cele mai mari și cu cea mai rapidă creștere colegii private din Tennessee. În anii 1990, Colegiul a adăugat primul său program de absolvire, un maestru al muzicii bisericești, la cele douăzeci și opt de specializări universitare. În 1996 studenți din patruzeci și șase de state și douăzeci și șapte de țări străine au participat la cursuri în campusul de șaizeci de acri din Centrul orașului Cleveland.
în 1996, Consiliul de Administrație al Colegiului Lee a decis să schimbe dramatic școala prin lansarea unui plan pentru instituția care solicita reorganizarea și desemnarea ca Universitatea Lee. La 1 August 1997, Universitatea Lee a fost oficial în vigoare; a inclus patru unități academice: un colegiu de Arte și științe Liberale, o școală de muzică, o școală de minister și un colegiu de educație. Consiliul a lăsat neafectat misiunea, obiectivele instituționale, politicile și procedurile de funcționare ale instituției. Astfel, legăturile puternice ale Universității Lee cu denumirea mamă și angajamentul său de a oferi o educație de înaltă calitate și accesibilă într-un context creștin continuă să ghideze prioritățile instituției. Universitatea Lee a rămas coeducațională de la înființarea sa și, în conformitate cu patrimoniul său Penticostal, operează Centrul de cercetare Penticostală, care se mândrește cu cele mai extinse colecții disponibile despre Penticostalism. Hotărâtă să-și mențină identitatea creștină mai largă, Universitatea Lee se identifică ca „un Campus în care Hristos este rege.”