CollegeEdit
Scarnecchia började sin tränarkarriär 1970 med sin alma mater California Western University som deras offensiv linje tränare, en position han innehade genom 1972. Från 1973 till 1974 var Scarnecchia assisterande offensiv linje och assistent defensiv backfield tränare för Iowa State University. 1975 började han en tvåårig tid med Southern Methodist University, först som doktorandassistent innan han befordrades till offensiv tränare vid anställning av huvudtränare Ron Meyer 1976. Från 1977 till 1978 fungerade Scarnecchia som offensiv tränare för University of the Pacific innan han tillbringade ett år på Northern Arizona University i samma kapacitet. Han återvände till Southern Methodist 1980 som offensiv tränare och tillbringade två säsonger där innan han följde huvudtränaren Ron Meyer till patrioterna.
NFLEdit
Scarnecchia gick med i patrioterna 1982 som speciallag och tight end coach. Från 1989 till 1990 tjänstgjorde han på Meyers Indianapolis Colts personal som deras offensiva tränare. Scarnecchia återvände till patrioterna 1991, där han tillbringade två säsonger under Dick MacPherson igen som speciallag och offensiv tränare. 1992 hade Scarnecchia ansvaret för huvudtränare medan MacPherson var sjuk för säsongens sista åtta matcher. Under huvudtränaren Bill Parcells 1993 och 1994 omfördelades Scarnecchia som specialassistent. 1995 omfördelades Scarnecchia igen, den här gången till en defensiv assistent. När Parcells lämnade laget efter 1996 New England Patriots säsong, och Pete Carroll anställdes som huvudtränare, Scarnecchia blev lagets speciallagstränare igen. I Carrolls sista säsong med patrioterna omfördelades Scarnecchia till offensiv tränare. Ny huvudtränare Bill Belichick utsåg dessutom Scarnecchia till lagets assisterande huvudtränare 2000.
Scarnecchia gick i pension efter säsongen 2013 och ersattes av Dave DeGuglielmo. Även efter att ha gått i pension som tränare arbetade Scarnecchia fortfarande med laget; till exempel hade han privata träningspass med de två offensiva linjemän som patrioterna utarbetade 2014, Bryan Stork och Cameron Fleming. Efter att patrioterna skilde sig från DeGuglielmo efter säsongen 2015 uttryckte patrioterna och Scarnecchia ömsesidigt intresse för att Scarnecchia skulle återvända för att coacha offensivlinjen 2016. Scarnecchia anslöt sig därefter till Patriots-personalen före säsongen 2016 och övervakade en återupplivande offensiv linje som endast tillät 16 säckar. Den 5 februari 2017 var Scarnecchia en del av Patriots coachingpersonal som vann Super Bowl LI. I spelet besegrade patrioterna Atlanta Falcons med poängen 34-28 på övertid. Hans son Steve är assistent till Atlanta Falcons huvudtränare Dan Quinn.