Blandningskartläggning är en metod för genkartläggning som använder en population av blandad härkomst (en blandad population) för att hitta de genetiska loci som bidrar till skillnader i sjukdomar eller andra fenotyper som finns mellan de olika förfädernas populationer. Metoden tillämpas bäst på populationer med ny blandning från två populationer som tidigare var genetiskt isolerade i tiotusentals år, såsom afroamerikaner och europeiska amerikaner (blandning av afrikanska och europeiska populationer). Metoden försöker korrelera graden av anor nära ett genetiskt locus med fenotypen eller sjukdomen av intresse. Genetiska markörer som skiljer sig i frekvens mellan förfädernas populationer behövs över genomet.
Blandningskartläggning baseras på antagandet att skillnader i sjukdomsfrekvenser eller fenotyper delvis beror på skillnader i frekvenserna för sjukdomsframkallande eller fenotyp-orsakande genetiska varianter mellan populationer. I en blandad population förekommer dessa kausala varianter oftare på kromosomala segment som ärvs från en eller annan förfäderpopulation. De första blandningsskanningarna publicerades 2005 och sedan dess har genetiska bidragsgivare till en mängd olika sjukdomar och dragskillnader kartlagts. Dessa inkluderar hypertoni, multipel skleros, BMI och prostatacancer hos afroamerikaner. År 2010 hade kartläggningspaneler med hög densitet konstruerats för afroamerikaner, Latino/latinamerikaner och uigurer.