Le Pen hyllade Brexit-omröstningen i Storbritannien i juni 2016 och valet av Donald Trump som USA: s president i November 2016 som bevis på den växande acceptansen av hennes principer. Trump hade kämpat på en bred antietablering, anti-invandring och anti-islamisk plattform, och hans framgång bland medelklass-och landsbygdsväljare tycktes vara bra för Le Pen inför Frankrikes presidentval 2017. Den 23 April 2017 slutade Le Pen på andra plats efter Emmanuel Macron, en pro-EU-centrist som hade fungerat som finansminister under Hollande, i den första omgången av presidentval.
bara några dagar före andra omgången släppte hackare tiotusentals interna e-postmeddelanden från Macrons kampanj i det som beskrivs som en ”massiv och samordnad” ansträngning för att störa valet. Cybersäkerhetsföretag kopplade attacken till samma ryska regeringsanslutna grupp som hade varit ansvarig för hackningen av det amerikanska Demokratiska Partiet före 2016 USA: s presidentval. Franska medier blackout regler i timmar före öppnandet av omröstningar effektivt förbjudit rapportering om händelsen, dock, och Le Pen misslyckades med att dra någon betydande nytta av läckorna. Drygt 75 procent av de röstberättigade rösterna röstade i andra omgången, Frankrikes lägsta valdeltagande i ett presidentval på nästan ett halvt sekel. Dessutom valde cirka fyra miljoner väljare—nästan 9 procent av dem som gick till omröstningarna—att kasta tomma eller avsiktligt bortskämda omröstningar som en protest mot båda kandidaterna. Av de återstående valbara omröstningarna fångade Le Pen cirka 34 procent av rösterna, nästan dubbelt så mycket som hennes fars totala mot Jacques Chirac i andra omgången av valet 2002.
även om hon slutade en avlägsen sekund till Macron, förklarade en trotsig Le Pen att National Front hade blivit det officiella oppositionspartiet till en Macron-ledd regering. Det uttalandet visade sig vara långt ifrån sant när lagstiftningsval hölls i juni 2017. National Front fångade bara åtta platser, betydligt färre än partiet hade beräknats vinna. Le Pen själv vann en parlamentarisk plats för första gången, som representerar h jacuzzin-Beaumont. Segern innebar att Le Pen var tvungen att avgå från Europaparlamentets säte som hon hade haft sedan 2004. Bara två veckor efter avgången placerades hon under brottsutredning av franska myndigheter för missbruk av medel under sin tid som parlamentsledamot. Europeiska byrån för bedrägeribekämpning, ett EU-organ som ansvarar för att utreda ekonomiska brott och korruption med EU-medel, hävdade att Le Pen hade missbrukat cirka 5 miljoner (5,4 miljoner dollar) på nationella Frontpartiets verksamhet.