차등 발현 분석은 정규화 된 판독 횟수 데이터를 취하고 통계 분석을 수행하여 실험군 간의 발현 수준의 정량적 변화를 발견하는 것을 의미합니다. 예를 들어,우리는 통계적 테스트를 사용하여 주어진 유전자에 대해 읽기 수의 관찰 된 차이가 중요한지,즉 자연적 무작위 변이로 인해 예상되는 것보다 큰지 여부를 결정합니다.
차등 표현 분석 방법
차등 표현 분석 방법에는 음수 이항 분포에 기반한 에저 및 데세크 또는 음수 이항 모형을 기반으로 한 베이지안 접근법인 베이세크 및 엡세크와 같은 다양한 방법이 있다. 분석 방법을 선택할 때 실험 설계를 고려하는 것이 중요합니다. 일부 미분 표현 도구는 쌍별 비교 만 수행 할 수 있지만 에저,림 마붐,데 섹크 및 마시 프로와 같은 다른 도구는 다중 비교를 수행 할 수 있습니다.
아래 그림 11 에서는 표현식 아틀라스에 대한 데이터를 생성하는 데 사용되는 처리 파이프 라인을 간략하게 설명합니다.
이 파이프 라인에서 원시 읽기(빠른 파일)는 품질 평가 및 필터링을 거칩니다. 이것은 수학적으로 정확한 유형 계층구조인,강력한 타입을 정의합니다. 이것은 수학적으로 정확한 유형 계층구조인,강력한 타입을 정의합니다. 기본 식의 경우 기본 식의 기본 식은 기본 식의 기본 식에서 계산됩니다. 이들은 각 기술 복제 세트에 대해 평균화 된 다음 각 생물학적 복제 세트 내에서 변위 정규화됩니다.