21.1 Clavispora Lusitaniae Rodrigues De Miranda (1979)
Anamorph: Candida lusitaniae van Uden & gør Carmo-Sousa
vækst på YM agar: efter 3 dage ved 25 kur C, cellerne er Subglobose, ovale til aflange, 2-6 liter 3-10 liter og forekommer enkeltvis, parvis eller i korte kæder. Væksten er butyrous, hvid til cremefarvet, glitrende eller lejlighedsvis kedelig og rugose.
vækst i glukose-gærekstrakt bouillon: lejlighedsvis kan væksten være flokkulent.
Dalmau plate culture on corn meal agar: efter 1 uge ved 25 liter C er pseudohyphae rigelige og veludviklede. Kolonier kan være omkranset med pseudohyphae.
dannelse af ascosporer: Asci er normalt bilobat, der indeholder en eller to, sjældent tre eller fire, clavate ascosporer (Fig. 21.2). Bud-parent konjugation er blevet observeret i en stamme (Fig. 21.2 F). Vorter kan (Rodrigues De Miranda 1984a) eller måske ikke (Rodrigues De Miranda 1979) være synlige ved elektronmikroskopi. Ascosporerne frigøres fra asci kort efter deres dannelse. I nogle kryds dannes sfæriske til ovoide ascosporer (Fig. 21.2 D). Rigelig sporulation forekommer 2-4 dage ved 17-25 liter C efter blanding af kulturer af kompatible parringstyper på 1% maltekstrakt agar eller YCBAS agar. Næsten alle isolater er frugtbare.
figur 21.2. Clavispora lusitaniae. (- EN) SUB 79-257.1 TIL CBS 4413. (B) Konjugationsrør og (C) CBS 6936-stik 94-252.1. D) ovoide ascosporer, G90-244,1 G90-207,5. Automiktisk stamme MTCC 1001, (E) konjugeret ascus; (F) autogamisk ascus; G) ASCI og agglutinerede ascosporer. Bar=5 liter. Lachance et al. (2003c), genoptrykt med tilladelse.
Fermentation
| Glucose | + |
| Galactose | v |
| Sucrose | v |
| Maltose | v |
| Lactose | − |
| Raffinose | − |
| Trehalose | v |
Growth (on Agar Media)
| Glucose | + |
| Inulin | − |
| saccharose | +1 |
| Raffinose | − |
| Melibiose | − |
| Galactose | v |
| laktose | − |
| Trehalose | + |
| Maltose | +1 |
| Melesitose | +1 |
| Methyl-L-D-glucosid | v |
| opløselig stivelse | − |
| Cellobiose | v |
| Salicin | +1 |
| l-Sorbose | + |
| l-Rhamnose | + |
| d-lose | + |
| l-Arabinose | − |
| d-Arabinose | v |
| d-Ribose | v |
| Methanol | − |
| Ethanol | + |
| Glycerol | + |
| Erythritol | − |
| Ribitol | +1 |
| Galactitol | − |
| Mannitol | + |
| Glucitol | +1 |
| myo-Inositol | − |
| dl-Lactate | v |
| Succinate | + |
| Citrate | v |
| d-Gluconate | v |
| d-Glucosamine | v |
| N-Acetyl-d-glucosamine | +1 |
| Hexadecane | v |
| Nitrate | − |
| Vitamin-free | − |
1 sjældent negativ (f.eks. stamme 92-308.1)
Additional Growth Tests and Other Characteristics
| Xylitol | + |
| 2-Keto-d-gluconate | + |
| d-Glucuronate | − |
| Glucono-δ-lactone | v |
| Amino acid-free | + |
| Nitrite | − |
| Ethylamine | + |
| Lysine | + |
| Cadaverine | + |
| 10% NaCl | + |
| 50% Glucose | v |
| Starch production | − |
| DBB | − |
| Gelatin | − |
| Casein | − |
| Tween 80 | v |
| Acid production | − |
| Cycloheximide 0.001% | +/v |
| 1% eddikesyre | − |
| vækst ved 30 kr | + |
| vækst ved 37 kr | + |
8 (Yamada og Kondo 1973).
Mol% G+C: 45,1–45,7, fem stammer, herunder CBS 4413 og CBS 6936 (Bd: Lachance et al. 1986).
gensekvenstiltrædelsesnumre, type stamme: D1/D2 LSU rRNA=U44817, SSU rRNA=AY497762. Allotype: D1 / D2 LSU rRNA=AY190538.
Cellecarbohydrater: Glucose og mannose (Susuki og Nakase 1998).
komplementære parringstyper: CBS 6936, parringstype h+ og CBS 4413, parringstype h−.
type stamme: CBS 6936.
systematik: Lachance og Phaff (1998a) opsummerede de tilgængelige oplysninger om variabiliteten hos arten ved assimilering af l-rhamnose, citronsyre og maltose. Et isolat fra knust agave, UVOPS92-308.1, hvis medlemskab af arten for nylig blev bekræftet (Lachance et al. 2003c), undladt at assimilere saccharose, Kurt-glucosider, Kurt-glucosider, ribitol, glucono-Kurt-lacton og N-acetyl-glucosamin. Identifikation baseret på vækstegenskaber er derfor upålidelig. I næsten alle tilfælde isoleres C. lusitaniae i form af haploide stammer, der kun gennemgår seksuel reproduktion efter blanding med en kompatibel parringstype. De to parringstyper ser ud til at være fordelt ligeligt i naturen. Stamme MTCC 1001 er unik i evnen til at danne asci alene ved en blanding af isogam og bud–forælder konjugation. Medlemskab af arten understøttes af D1 / D2-sekvensen, som er identisk med allotypens. På trods af opdagelsen af en automiktisk stamme opnås morfologisk identifikation af C. lusitaniae mest bekvemt ved parring af ukendte med stammer af kendte parringstyper (Franrius et al. 2001). Desværre parrer allotypen, CBS 4413, Dårligt. Franrius et al. (2001) og Lachance et al. (2003c) give lister over forskellige stammer og deres parring effektivitet.
arten er forbløffende polymorf i de store underenhed rDNA-sekvenser, som kan variere med over 30 substitutioner i D2-domænet (Lachance et al. 2003c). Der er imidlertid ingen sammenhæng mellem evnen til at danne modne asci ved parring af par og deres omfang af sekvensdivergens. Nogle haploide stammer er heterogene for variantsekvenserne, hvilket indikerer, at dette er et sjældent tilfælde, hvor en art i det væsentlige er polymorf for denne normalt konserverede markør. Hvordan en sådan polymorfisme opstod, er ikke klart. En plausibel forklaring er, at arten blev opdelt i to forskellige populationer i tilstrækkelig tid til at tillade divergensen at finde sted, men uden udvikling af en postsygotisk isoleringsmekanisme. Genforening af befolkningerne, muligvis gennem kontinental drift, ville så have tilladt sameksistensen af sekvensvarianterne i en enkelt Mendelsk befolkning.
økologi: den økologiske niche af C. lusitaniae er dårligt defineret. Selvom gæren forekommer i kaktus, kan den ikke betragtes som kaktofil, idet den kun er rapporteret lejlighedsvis i næsten 2000 prøver (Starmer et al. 1990). Flere stammer blev genvundet fra nekrotisk kaktusvæv i Antigua af P. F. Ganter. Interessant nok gav disse prøver ikke nogen C. opuntiae, som det normalt ville forventes af dette habitat. I en undersøgelse af gær forbundet med agave dyrket til tekvilproduktion fandt Lachance (1993b) C. lusitaniae at være den mest rigelige art i eddikesyrerødder ved bunden af blade i denne plante.
bioteknologi: ukendt
landbrug og fødevarer: ukendt
klinisk betydning: Clavispora lusitaniae genvindes regelmæssigt i kliniske prøver, men betragtes ikke som et ægte humant patogen (Hurley et al. 1987). Det blev først anerkendt som en opportunistisk infektiøs organisme af Holtschu et al. (1979), og er siden dukket op i over 100 prøver fra patienter, der lider af immundefekter (Gargeya et al. 1990). En undersøgelse af 35 kliniske isolater. 1992) afslørede, at en betydelig mængde variation i kromosomstørrelser forekommer fra klon til klon. Disse stammer kunne på basis af deres elektrokaryotyper tildeles 15 grupper svarende til de 15 patienter, hvorfra de var blevet isoleret.