La encefalitis transmitida por garrapatas, o TBE, es una enfermedad infecciosa viral humana que afecta al sistema nervioso central. La TBE es causada por el virus de la encefalitis transmitida por garrapatas (TBEV), un miembro de la familia Flaviviridae, y fue aislado inicialmente en 1937. Se describen tres subtipos de virus: el virus de la encefalitis transmitida por garrapatas europeas u occidentales, el virus de la encefalitis transmitida por garrapatas siberianas y el virus de la encefalitis transmitida por garrapatas del Lejano Oriente (anteriormente conocido como virus ruso de la encefalitis de Primavera y Verano, RSSEV).
La familia Flaviviridae incluye varios virus transmitidos por garrapatas que afectan a los seres humanos. Estos virus están estrechamente relacionados con el TBEV y el TBE del Lejano oriente, e incluyen el virus de la fiebre hemorrágica de Omsk en Siberia, el virus de la enfermedad de los bosques de Kyasanur en la India y su pariente cercano, el virus Alkhurma en Arabia Saudita. El virus Louping ill (Reino Unido) también es un miembro de esta familia; causa la enfermedad principalmente en ovejas y se ha informado como la causa de una enfermedad similar a la TBE en trabajadores de laboratorio y personas con contacto con ovejas enfermas (por ejemplo, veterinarios, carniceros). En los Estados Unidos y Rusia, otro flavivirus transmitido por garrapatas, el virus Powassan, es responsable de la encefalitis en humanos.