január 1, 1918, 12 diákok négy állam találkozott Nora Chambers egy emeleti szobában a Church of God kiadó Cleveland, Tennessee. Ez az első osztályú találkozó a Church of God ‘ s Bible Training School (BTS) vezetett az alapító Lee University. Kezdetben Chambers szolgált az egyetlen kar tagja, és a tucat diák tette ki az egész hallgatói szervezet. Az első két diplomás 1919 áprilisában szerezte meg diplomáját, 1919 szeptemberében pedig levelezőprogramot indítottak, amely az iskola Általános beiratkozását 788 hallgatóra növelte. A következő évtizedekben a BTS kibővítette karát és tantervét, és 1938-ban Sevierville-be költözött.
1947-ben BTS visszaköltözött Cleveland, elfoglalt egy nemrég vásárolt nagyobb campus, és nevezték Lee College tiszteletére Flavius J. Lee, egy korai vezetője a felekezet és második elnöke az iskola. A főiskola kiterjesztette a hangsúlyt, hogy magában foglalja mind a bibliai tanulmányokat, mind a hagyományos bölcsészettudományokat egy négyéves tantervben. 1959-ben Lee Bibliaiskoláját a Bibliaiskolák Akkreditáló Szövetsége akkreditálta, 1960-ban pedig egy junior főiskolát Akkreditált a főiskolák és iskolák déli Szövetsége (SACS). 1969-ben a SACS teljes akkreditációt adott Lee-nek négyéves Bölcsészettudományi főiskolaként. Az 1970-es évektől az 1990-es évek elejéig Lee óriási növekedést tapasztalt, több mint 2600 hallgatóra növelve beiratkozását, így Tennessee egyik legnagyobb és leggyorsabban növekvő magániskolája. Az 1990-es években a főiskola huszonnyolc egyetemi hallgatójához hozzáadta első posztgraduális programját, az egyházi zene mesterét. 1996-ban a diákok negyvenhat állam és huszonhét külföldi vett részt osztályok a hatvan hektáros campus belvárosában Cleveland.
ban ben 1996 A Lee College Igazgatóság elhatározta, hogy változtatni az iskola drámaian indít egy tervet az intézmény, amely felszólított átszervezés és kijelölése Lee Egyetem. Augusztus 1, 1997, Lee Egyetem hivatalosan a helyén; ez magában foglalta a négy tudományos egységek: a College of Liberal Arts and Sciences, A School of Music, A School of Ministry, és a College of Education. Az igazgatóság nem befolyásolta az intézmény küldetését, intézményi céljait, politikáit és működési eljárásait. Így a Lee University szoros kapcsolata a szülői felekezethez és elkötelezettsége a magas színvonalú, megfizethető oktatás keresztény kontextusban történő biztosítása iránt továbbra is irányítja az intézmény prioritásait. Lee Egyetem maradt koedukációs alapítása óta, és összhangban a pünkösdi örökség, működik a pünkösdi kutatóközpont, amely büszkélkedhet a legszélesebb gyűjtemény elérhető pünkösdi. Elhatározta, hogy fenntartja tágabb alapú keresztény identitását, a Lee Egyetem “egyetemként azonosítja magát, ahol Krisztus a király.”