Le Pen hyldede afstemningen i Storbritannien i Juni 2016 og valget af Donald Trump som præsident for De Forenede Stater i November 2016 som bevis for den voksende accept af hendes principper. Trump havde kæmpet for en bredt anti-etablering, anti-indvandring og anti-islamisk platform, og hans succes blandt middelklasse-og landlige vælgere syntes at bode godt for Le Pen forud for Frankrigs præsidentvalg i 2017. Den 23. April 2017 sluttede Le Pen på andenpladsen til Emmanuel Macron, en pro-EU-centrist, der havde tjent som finansminister under Hollande, i den første runde af præsidentvalg.
bare dage før anden runde frigav hackere titusinder af interne e-mails fra Macrons kampagne i det, der blev beskrevet som en “massiv og koordineret” indsats for at forstyrre valget. Cybersikkerhedsfirmaer forbandt angrebet med den samme russiske regeringstilknyttede gruppe, der havde været ansvarlig for hacking af det amerikanske demokratiske parti forud for det amerikanske præsidentvalg i 2016. Franske medier blackout regler i timerne før åbningen af meningsmålinger effektivt forbudt rapportering om hændelsen, imidlertid, og Le Pen undlod at udlede nogen væsentlig fordel af lækagerne. Lidt over 75 procent af stemmeberettigede stemmer i anden runde, Frankrigs laveste valgdeltagelse i et præsidentvalg i næsten et halvt århundrede. Derudover valgte omkring fire millioner vælgere—næsten 9 procent af dem, der gik til afstemningerne—at afgive blanke eller forsætligt forkælet stemmesedler som en protest mod begge kandidater. 34 procent af stemmerne, næsten dobbelt så stor som sin fars samlede mod Chirac i anden runde af valget i 2002.
selvom hun sluttede et fjernt sekund til Macron, erklærede en trodsig Le Pen, at National Front var blevet det officielle oppositionsparti til en Macron-ledet regering. Denne erklæring viste sig at være langt fra sand, da der blev afholdt lovgivningsvalg i Juni 2017. National Front erobrede kun otte pladser, betydeligt færre end partiet havde forventet at vinde. Le Pen vandt selv et parlamentarisk sæde for første gang, der repræsenterer H. Sejren betød, at Le Pen måtte træde tilbage fra Europa-Parlamentets sæde, som hun havde haft siden 2004. Kun to uger efter at hun trådte tilbage, blev hun sat under strafferetlig efterforskning af franske myndigheder for misbrug af midler i sin tid som MEP. Det Europæiske Kontor for bekæmpelse af svig, et EU-organ, der har til opgave at efterforske økonomiske forbrydelser og korruption, der involverer EU-midler, hævdede, at Le Pen havde brugt omkring 5 millioner (5,4 millioner dollars) forkert på National Front party-forretning.