アミンの解任後、ウガンダ民族解放戦線はユスフ・ルールを大統領、エレミヤ・ルーカス・オピラをUNLFの事務総長とした暫定政府を結成した。 この政府は、行政の閣僚制度を採用し、国家協議委員会（NCC）として知られている準議会機関を作成しました。 NCCとルール内閣は、政治的見解が大きく異なることを反映していた。 1979年6月、大統領権限の範囲をめぐる論争の後、NCCはルールをゴドフリー・ビナイサに置き換えた。
暫定大統領の権限をめぐる継続的な論争の中で、ビナイサは1980年5月に解任された。 その後、ウガンダはパウロ-ムワンガが議長を務める軍事委員会によって支配された。 1980年12月の選挙では、ミルトン・オボテの指導の下でUPCが政権を奪還し、ムワンガが副大統領に就任した。 オボテの下で、治安部隊は世界最悪の人権記録の一つを持っていました。 Yoweri Museveniの国民抵抗軍（NRA）が率いる反乱を鎮圧するための努力の中で、彼らは特にカンパラの北のLuwero地域で、国のかなりの部分に浪費をしました。
オボテは27July1985まで支配し、バジリオ-オラーラ＝オケロ中将が指揮する陸軍旅団がカンパラを占領し、軍事政権を宣言した。 オボテはザンビアに亡命した。 元国防軍司令官のティト-オケロ将軍（中将とは関係ない）が率いる新体制。 オラーラ-オケロ）は、ムセベニの反乱軍との交渉を開始し、人権の尊重を改善し、部族の競争を終わらせ、自由で公正な選挙を行うことを約束した。 一方、大規模な人権侵害は、オケロ政府がNRAの支援を破壊しようとする残忍な反反乱を実行したために続けられました。
オケロ政権とNRAの交渉は1985年秋にナイロビで行われ、ケニアのダニエル・アラップ・モイ大統領はウガンダで停戦と連立政権を求めた。 1985年末には停戦に合意したが、NRAは戦闘を続け、1986年1月下旬にカンパラと同国を占領し、オケロの部隊はスーダンに北に逃げることを余儀なくされた。 ムセベニの軍はムセベニを大統領として政府を組織した。
政権を握って以来、ムセベニとその追随者によって作られた政治的グループ、国家抵抗運動（NRMまたは”運動”）によって支配されていた政府は、以前の政府の人権侵害に大部分を終止符を打ち、実質的な政治自由化と一般的な報道の自由を開始し、国際通貨基金、世界銀行、ドナー政府と協議した後、広範な経済改革を実施している。
アチョリランドのような北部地域では、1986年以来、政府に対する武装抵抗があった。 アチョリを拠点とする反政府勢力には、ウガンダ人民民主軍や聖霊運動が含まれていた。 唯一残っている反乱軍は、ジョゼフ-コニー率いる主の抵抗軍であり、その反乱は子供を強制的に募集したり、性奴隷として使用したりするために子供を広範に拉致した。
1996年、ウガンダは第一次コンゴ戦争におけるザイリアン大統領モブツ-セセ-セコの打倒の重要な支持者であり、反乱指導者ローラン-デジレ-カビラを支持していた。
21st century edit
1998年から2003年の間、ウガンダ軍はコンゴ民主共和国での第二次コンゴ戦争に関与していた。 ウガンダは、コンゴ解放運動とコンゴ民主主義のための集会のいくつかの派閥のためにそこに反乱グループをサポートし続けています。
2005年8月、議会は大統領の任期制限を解除するために憲法を変更することを投票し、ムセベニがそうすることを望むならば三期目の選挙を許可した。 2005年9月2日に行われた国民投票では、次のように述べられている。有権者の5％が多党政治の回復を支持し、それによって無党派または”運動”システムを廃止した。 ムセベニの政治的ライバルであったキッツァ・ベシゲは2005年10月に亡命から帰国し、2006年の選挙で大統領候補となった。 同月、オボテは南アフリカで死去した。 2006年2月の大統領選挙でムセベニが勝利した。
2009年、反同性愛法案が提案され、検討中である。 2009年10月13日にダヴィド・バハティ議員によって提案され、もしそれが制定されれば、ウガンダにおける同性愛の犯罪化を拡大し、以前の有罪判決を受けた者、HIV陽性者、または18歳未満の者と性的行為を行った者に対する死刑を導入し、ウガンダ外で同性の性的関係に従事した者に対する引き渡しを導入し、lgbtの権利を支持した個人、企業、メディア団体、または非政府組織に対して刑罰を科すことになった。
2010年7月11日、アル・シャバブ爆撃機がカンパラで74人を殺害した。 2014年9月13日、ウガンダの治安情報局は、米国の支援を受けて、カンパラでの大規模なテロ攻撃を特定し、阻止した。 彼らは自殺ベスト、即席の爆発装置、小型武器を回収し、アル-シャバブと関係があると疑われた19人を逮捕した。 この攻撃は、前年のウェストゲートモールでのナイロビの攻撃と同じくらい重要であった可能性があります。 代わりに、それはal-Shabaabのための失敗でした。
2016年ウガンダ総選挙が2016年2月18日にウガンダで開催され、大統領と議会が選出された。 投票日は国民の祝日と宣言されました。 選挙に先立ち、ムセベニ氏は、ウガンダ、タンザニア、ケニア、ルワンダ、ブルンジ、南スーダンを結ぶ東アフリカ連合の結成を”目指すべきナンバーワンの目標”と述べた。「2018年9月には、地域憲法の起草プロセスを開始するための委員会が結成され、2021年までに連合の憲法草案が作成され、2023年までに連合の実施が予定されています。
2021年ウガンダ総選挙でムセベニ大統領が再選されたが、国際的なオブザーバーは政府の暴力と偽情報、独立メディアと野党の選挙運動の抑圧、野党指導者の逮捕、インターネットの停止、オブザーバーの嫌がらせを訴えた。 公式の結果によると、ムセベニは投票の58％で選挙に勝ったが、ポップスターになった政治家のボビ-ワインは35％を持っていた。 野党は、広範な詐欺や不正行為の主張のために結果に挑戦した。