기능 섹션의 이 하위 섹션은 단백질 내에서 아연 핑거의 위치(들)및 유형을 지정합니다.
아연 핑거는 하나 이상의 아연 이온을 조정하여 시스테인 및/또는 히스티딘 잔기를 통해 구조를 안정화시키는 작고 기능적이며 독립적으로 접힌 도메인입니다. 아연 손가락은 구조적으로 다양하며 단백질-단백질 상호 작용 및 막 협회에 이르기까지 다양한 기능을 나타냅니다.
아연 핑거의 종류
유니프로트비에는 40 가지 이상의 아연 핑거가 주석이 붙어 있습니다. 이 경우,이 유형의 고환은 고환의 가장 흔한 유형 중 하나입니다.1986 년 11 월 25 일,2019 년 11 월 25 일,2576 년 11 월 25 일,2576 년 11 월 25 일,2576 년 11 월 25 일,2576 년 11 월 25 일,2576 년 11 월 25 일,2576 년 11 월 25 일,2576 년 11 월 25 일,2576 년 11 월 25 일,2576 년 11 월 25 일,2576 년 11 월 25 일,2576 년 11 월 25 일,2576 년 인터 프로 자원 프로 사이트,팸 및 스마트. 예측 아연 손가락의 수와 유형은’가족 및 도메인’섹션의’시퀀스 유사성’하위 섹션에 지정됩니다.아연 손가락 단백질은 호모 사피엔스의 게놈에서 가장 빈번하게 발생하는 단백질 중 하나이다. 대부분의 아연 손가락 단백질은 유전자에 결합하는 전사 활성제 또는 억제제입니다. 2 형 아연 손가락은 동일한 단백질에 여러 개의 사본에서 자주 발견되며,이 경우 개별 사본에 번호가 매겨집니다. 아연 손가락의 번호 매기기는 단백질이 엔-말단에서 단편이고 정확한 번호 매기기를 추론 할 수있는 완전한 직교 서열을 사용할 수없는 경우 선택 사항입니다.
:
C-x(2,4)-C-x(3)--x(8)-H-x(3,5)-H
이 프로파일은 첫 번째 시스테인(일반적으로 방향족 잔기로 시작)이전의 2 잔기에서 두 번째 히스티딘으로 연장됩니다. 할당된 범위는 일반적으로 프로파일의 범위입니다.
예: 아연 손가락은 종종 다음과 같은 도메인과 관련이있다:리아(전사 억압),스캔 상자 또는 레르(올리고머 화-항상 리아의 경우 리아는 단백질에 존재),비티/포즈이-스캔 또는 리아와 함께 발견되지 않음),세트(메틸화)및 호모 박스(결합). 호모 박스 도메인을 제외하고,이러한 다른 도메인은 거의 항상 엔-말단 부분 의 단백질 전에 아연 손가락.
비)비정형 및 퇴화 된 아연 손가락
비정형 아연 손가락은 합의 프로파일 또는 패턴에서 벗어나지 만 그럼에도 불구하고 아연 결합 능력을 유지하는 것입니다. 이들은 시스테인이 히스티딘으로 대체되는 또는 시스테인 또는 히스티딘 잔류물 사이 간격이 뒤에 오는 방법의 한에서 경미하게 바꾸이는 아연 손가락을 포함할 수 있습니다:
C-x(5)-C instead of C-x(2,4)-C; C-x(10,14)-H instead of C-x(12)-H; H-x(2)-H or H-x(6)-H instead of H-x(3,5)-H.
변성 아연 손가락은 합의 프로파일 또는 패턴에서 벗어나 아연 결합 능력을 상실한 손가락입니다. 여기에는 시스테인이 히스티딘 이외의 아미노산으로 대체되거나 시스테인 또는 히스티딘 잔기 사이의 간격이 정상 또는 비정형 아연 손가락 또는 잘린 아연 손가락의 범위를 벗어나는 아연 손가락이 포함될 수 있습니다.2019>
에서 표현되지 않은 아연 핑거의 주석 많은 아연 핑거는 아연 이온을 조정하는 아미노산만이 보존되는 것으로 특정 가족 프로파일 또는 패턴에 의해 설명 될 수 없다. 따라서 이러한 아연 손가락의 수와 유형은’가족 및 도메인’섹션의’시퀀스 유사성’하위 섹션에 지정되지 않았습니다.
이러한 아연 손가락은 일반적으로 아연 이온을 조정하는 시스테인 또는 히스티딘 잔기의 패턴으로 명명됩니다.
씨 4 형 아연 핑거
씨 4 형 아연 핑거는 아연을 조정하고 더 이상의 서열 유사성을 공유하지 않는 4 개의 시스테인 잔기를 특징으로 한다-예를 들어,시스테인 잔기 사이의 거리는 보존되지 않는다. 핵 수용 체의 일부 잘 특성화 된 가족의 유전자 바인딩 영역 내에서 발견 된다.고세균과 박테리아에서 4 형 아연 손가락은 일부 보존 된 단백질 군을 포함하여 제한된 수의 단백질에서 발견됩니다. 이 두 가지 유형의 가족 중 일부는 다음과 같습니다.이 두 가지 유형의 가족 중 일부는 다음과 같습니다. 우리는 이러한 고도로 보존 된 4 형 아연 손가락에 주석을 달지 만,좋은 증거가 없다면 다른 단백질에서는 발견되지 않습니다.
예: 관련 키워드:
금속 결합,
아연,
아연 손가락.
참조:
도메인
모티브
영역
반복