pigmenty dodatkowe są związkami pochłaniającymi światło, występującymi w organizmach fotosyntetycznych, które działają w połączeniu z chlorofilem a. obejmują one Inne formy tego pigmentu, takie jak chlorofil b w zielonych algach i wyższych antenach roślinnych, podczas gdy inne glony mogą zawierać chlorofil c lub d. ponadto istnieje wiele nie-chlorofilowych pigmentów pomocniczych, takich jak karotenoidy lub fikobiliproteiny, które również pochłaniają światło i przenoszą tę energię świetlną do fotosystemu chlorofil. Niektóre z tych dodatkowych pigmentów, w szczególności karotenoidy, służą również do pochłaniania i rozpraszania nadmiaru energii świetlnej lub działają jako przeciwutleniacze. Duża, fizycznie związana Grupa chlorofili i innych pigmentów pomocniczych jest czasami określana jako łóżko pigmentowe.
różne pigmenty chlorofilowe i nie-chlorofilowe związane z fotosystemami mają różne widma absorpcji, albo dlatego, że widma różnych pigmentów chlorofilowych są modyfikowane przez lokalne środowisko białkowe, albo dlatego, że pigmenty dodatkowe mają wewnętrzne różnice strukturalne. Rezultatem jest to, że In vivo, złożone spektrum absorpcji wszystkich tych pigmentów jest rozszerzone i spłaszczone w taki sposób, że szerszy zakres promieniowania widzialnego i podczerwonego jest absorbowany przez rośliny i glony. Większość organizmów fotosyntetycznych nie absorbuje dobrze zielonego światła, dlatego większość światła pozostałego pod baldachimami liści w lasach lub pod wodą z obfitym planktonem jest zielona, efekt widmowy zwany „Zielonym oknem”. Organizmy takie jak niektóre cyjanobakterie i czerwone algi zawierają dodatkowe fikobiliproteiny, które pochłaniają Zielone światło docierające do tych siedlisk.
w ekosystemach wodnych jest prawdopodobne, że spektrum absorpcji wody, wraz z gilvinem i tryptonem (odpowiednio rozpuszczoną i zawieszoną materią organiczną), determinuje fototroficzne zróżnicowanie nisz. Sześć ramion w absorpcji światła wody o długości fali 400-1100 nm odpowiada korytom w zbiorowej absorpcji co najmniej dwudziestu różnych gatunków bakterii fototropowych. Inny efekt wynika z ogólnej tendencji do pochłaniania niskich częstotliwości przez wodę, podczas gdy gilvin i tripton pochłaniają wyższe. To dlatego otwarty ocean wydaje się niebieski i wspiera żółte gatunki, takie jak Prochlorokok, który zawiera diwinylo-chlorofil a i b. Synechococcus, zabarwiony na Czerwono z fikoerytryną, jest przystosowany do organizmów przybrzeżnych, podczas gdy fikocyjanina pozwala cyjanobakterii rozwijać się w ciemniejszych wodach śródlądowych.