Accessori sono pigmenti che assorbono la luce composti, trovato in organismi fotosintetici, che opera in collaborazione con clorofilla. Essi comprendono altre forme di questo pigmento, come la clorofilla b nel verde di alghe e piante superiori antenne, mentre altre alghe possono contengono clorofilla c o d. In aggiunta, ci sono molti non-clorofilla accessorio pigmenti, come i carotenoidi o ficobiliproteina, che anche assorbire la luce e il trasferimento di energia di luce al fotosistema clorofilla. Alcuni di questi pigmenti accessori, in particolare i carotenoidi, servono anche ad assorbire e dissipare l’energia luminosa in eccesso, o funzionano come antiossidanti. Il grande gruppo fisicamente associato di clorofille e altri pigmenti accessori è talvolta indicato come un letto di pigmento.
I diversi pigmenti di clorofilla e non clorofilla associati ai fotosistemi hanno tutti spettri di assorbimento diversi, sia perché gli spettri dei diversi pigmenti di clorofilla sono modificati dal loro ambiente proteico locale o perché i pigmenti accessori hanno differenze strutturali intrinseche. Il risultato è che, in vivo, uno spettro di assorbimento composito di tutti questi pigmenti viene ampliato e appiattito in modo tale che una gamma più ampia di radiazioni visibili e infrarosse viene assorbita dalle piante e dalle alghe. La maggior parte degli organismi fotosintetici non assorbe bene la luce verde, quindi la maggior parte della luce rimanente sotto i baldacchini delle foglie nelle foreste o sott’acqua con abbondante plancton è verde, un effetto spettrale chiamato “finestra verde”. Organismi come alcuni cianobatteri e alghe rosse contengono ficobiliproteine accessorie che assorbono la luce verde che raggiunge questi habitat.
Negli ecosistemi acquatici, è probabile che lo spettro di assorbimento dell’acqua, insieme a gilvin e tripton (materia organica disciolta e particolata, rispettivamente), determini la differenziazione della nicchia fototrofica. Le sei spalle nell’assorbimento della luce dell’acqua tra le lunghezze d’onda 400 e 1100 nm corrispondono alle depressioni nell’assorbimento collettivo di almeno venti diverse specie di batteri fototrofi. Un altro effetto è dovuto alla tendenza generale dell’acqua ad assorbire le basse frequenze, mentre gilvin e tripton assorbono quelle più alte. Questo è il motivo per cui l’oceano aperto appare blu e supporta specie gialle come Prochlorococcus, che contiene divinil-clorofilla a e b. Synechococcus, colorato di rosso con ficoeritrina, è adattato ai corpi costieri, mentre la ficocianina consente ai cianobatteri di prosperare nelle acque interne più scure.