deoarece musculatura scheletică nu este capabilă să utilizeze ciclul ureei pentru a elimina în siguranță ionii de amoniu generați în defalcarea aminoacizilor lanțului de ramură, trebuie să scape de acesta într-un mod diferit. Pentru a face acest lucru, amoniacul este combinat cu cetoglutaratul liber de-al VIII-lea printr-o reacție de transaminare în celulă, producând glutamat și acid-ceto-al VIII-lea. Alanin aminotransaminaza (ALT) acoperă apoi glutamatul înapoi în cetoglutarat de cetoglutarat, de data aceasta transferând amoniul în piruvat rezultat din glicoliză, formând alanină liberă. Aminoacidul alanină acționează ca o navetă – părăsește celula, intră în fluxul sanguin și călătorește către hepatocite din ficat, unde în esență acest întreg proces este inversat. Alanina trece printr-o reacție de transaminare cu cetoglutarat liber-cetoglutarat pentru a produce glutamat, care este apoi deaminat pentru a forma piruvat și, în cele din urmă, ion de amoniu liber. Hepatocitele sunt capabile să metabolizeze amoniul toxic prin ciclul ureei, eliminându-l astfel în siguranță. După ce a scăpat cu succes celulele musculare ale ionului de amoniu, ciclul furnizează apoi celulele musculare scheletice lipsite de energie cu glucoză. Piruvatul format din dezaminarea glutamatului în hepatocite suferă gluconeogeneză pentru a forma glucoză, care poate intra apoi în fluxul sanguin și poate fi transferat în țesutul muscular scheletic, oferindu-i astfel sursa de energie de care are nevoie.
ciclul Cahill necesită prezența alanin aminotransferazei (alanin transaminază, ALT), Care este limitată la țesuturi precum mușchi, ficat și intestin. Prin urmare, această cale este utilizată în locul ciclului Cori numai atunci când este prezentă o aminotransferază, când este necesară transferul amoniacului în ficat și când corpul se află într-o stare de catabolism (defalcare musculară).