코모도 드래곤 혈액의 세포 유형
필요한 안전 및 규제 절차에 따라 적절한 승인을 받아 세인트 어거스틴 악어 농장 동물 공원에서 투자라는 코모도 드래곤으로부터 혈액 샘플을 얻었다. 또한,우리는 우리의 단백질 연구 촉진 하기 위해 유전자 라이브러리를 생성 하는 게놈 유전자 시퀀싱 뿐만 아니라 수집에 관심이 있었다. 새에서 이종 세포(백혈구)는 여러 항균 펩타이드를 발현하는 것으로 알려져 있습니다. 닭 이종에서 확인 된 항균 성 펩 티 드 중요 한 항균 및 호스트 지시 면역 활동을 전시. 따라서,신선한 코모도 드래곤 혈액의 초기 샘플을 얻은 후 우리 혈액에서 정착 하는 백혈구를 허용 하 고 그들은 항균 펩 티 드 발현과 관련 될 가능성이 있었기 때문에 그들을 수집. 수집 된 코모도 드래곤 백혈구는 다음 절반 시퀀싱 및 라이브러리 생성에 대 한 준비에 게놈 유전자 분리에 대 한 처리 되 고 균등 하 게 분할 되었다 그리고 나머지 절반은 우리의 단백질 연구에 대 한 추출에 대 한 예약.
그런 다음 얼룩을 수행하고 관찰 한 다양한 세포 유형을 확인했습니다. 코모도 드래곤 혈액의 면역 세포 식별은 참조 용으로 제한된 출판 된 문헌으로 인해 도전적입니다. 라이트 염색 혈액 도말에서 관찰 된 다양한 세포 유형은 그림 1 에 나와 있습니다. 2. 우리는 우리가 미국 악어 혈액에서 이전에 확인했었던 면역 세포에 상사성에 근거를 둔 이 세포를 확인했습니다. 이 파충류의 크고 길쭉한 핵 생성 적혈구가 흥미로 웠습니다. 또한,우리는 단핵구 및 림프구 세포뿐만 아니라 카텔리시딘 펩타이드의 가능한 공급원 인 이종 세포(과립구와 유사)를 식별 할 수있었습니다.
코모도 드래곤 적혈구와 면역 세포. 코모도 드래곤에서 혈액 세포 라이트 얼룩에 의해 시각화 하 고 40 배에서 이미징 했다.
코모도 드래곤 혈액의 두 번째 샘플은 나중에 추가 시퀀싱을 위해 더브 테일 유전체학에 의해 게놈 추출을 위해 수집 및 처리되었습니다. 더브 테일 유전체학의 연구자들은 백혈구를 분리하지 않았고,대신 전혈에서 직접 펠렛 세포에서 유전자를 추출했다.
코모도 드래곤 게놈의 조립 및 주석
유세포 측정법을 사용한 코모도 드래곤 적혈구의 이전 분석은 게놈의 크기가 약 1.93 기가바이트라고 추정했습니다. 깊은 일루미나 시퀀싱 및 더브 테일 접근 방식을 사용하여,우리는 1.78 기가바이트입니다 캐롤린 시스 도마뱀 게놈의 게놈 크기와 유사한 1.60 기가바이트이었다 초안 게놈 어셈블리를 얻을. 2015 년 12 월 15 일(목),2015 년 12 월 15 일(목),2015 년 12 월 15 일(목) 총 17,213 개의 유전자가 예측되었으며 그 중 16,757 개(97.35%)가 주석을 달았습니다. 세그 마를 사용한 완전성 추정치는 56%(‘완전’)와 94%(‘부분’)였습니다. 게놈에서 반복의 예상 비율은 35.05%대부분 인 라인(38.4%)와 사인(5.56%)(추가 파일 1:그림. 2518>추가 파일 2:테이블 1). 바둑은 보드게임입니다,바둑은 181 개의 흑돌과 180 개의 백돌 그리고 바둑판으로 이루어집니다. 이 문서에 설명된 어셈블리 버전은 다음과 같습니다.
잠재적인 타고 난 면역과 항균 성 펩 티 드 유전자의 식별
파충류에서 타고 난 면역은 그들의 진화 성공의 중요 한 측면 이지만 그것은 제대로 이해이 동물에서 남아 있다. 선천적인 면제는 항체 및 티세포를 아닙니다 면역의 그 양상으로 정의됩니다. 침입하는 병원체에 대한 타고난 면역 반응에는 사이토 카인의 발현;대 식세포,백혈구 및 기타 백혈구의 활성화 및 모집;디펜 신 및 카텔리시딘과 같은 항균 펩타이드의 발현.
우리는이 작품에서 코모도 드래곤 게놈에서 타고 난 면역 유전자를 식별 하는 게놈 기반 접근 방식을 촬영 했습니다. 우리는 코모도 게놈을 시퀀싱 하 고 유전자와 중요 한 타고 난 면역 항균 펩 티 드 유전자 클러스터에 대 한 그것을 조사 했습니다.
코모도 게놈의 디펜신 및 관련 유전자
디펜신은 이황화 안정화 된 항균 펩타이드의 한 예이며,디펜신은 상피 표면에서 미생물 식민지화에 대한 내성에 관여하는 이황화 안정화 된 양이온 성 항균 펩타이드의 고유 한 척추 동물 계열이다. 시스테인 잔기 간격이 보존된 특징적인 6-시스테인 모티프(씨–엑스 6–씨–엑스(3-5)–씨–엑스(8-10)–씨–엑스 6–씨-씨-엑스)및 관련 디설파이드 결합 패턴(씨-씨 5,씨-씨 4 및 씨-씨 3-씨 6)에 의해 정의된다;그러나,시스테인 잔기 사이의 수와 간격의 변화가 관찰되었다. 다른 양이온 성 항균 펩타이드와 마찬가지로,제 2-디펜 신은 전형적으로 순 양성(양이온 성,염기성)전하를 나타낸다.
파충류에서 디페신 펩타이드 발현에 대한 생체 내 역할에 대한 최초의 광범위한 보고서 중 하나는 상처 입은 아놀 도마뱀(아놀리스 카롤리넨시스)에서 디페신의 유도 가능한 발현이다. 파충류 호중구는 카텔리시딘 유사 펩타이드뿐만 아니라 2 차-디펜신 펩타이드를 모두 포함하는 과립을 갖는 것으로 보인다. 파충류 알에서도 디펜신 유사 펩타이드가 발견됩니다. 일부 종의 도마뱀은 포식자 탈출 방법으로 꼬리를 잃을 수 있으며,이 꼬리는 염증이나 감염없이 상처 부위에서 재생된다는 것은 잘 알려져 있습니다. 2013 년 12 월 15 일-디펜신 펩티드는 상처층과 관련된 상피에서 아즈로필릭 과립구 내에서 발현되며,분해된 박테리아를 포함하는 파고좀에서 관찰된다. 재생과 관련된 상처에 염증의 뚜렷한 부족이있다,그리고 두 개의 디펜스 특히 전체 치유 조직에서 높은 수준으로 표현된다,에 대한 중요한 역할이있을 것으로 보인다 디펜스-아놀 도마뱀의 상처 치유 및 재생에 디펜스.
β 착 색에 대 한 방어에 역할이 유전자가 일반적으로 관찰하에 거주하는 클러스터 내에서의 유전자릅니다. 인간의 경우,33 개의 유전자가 5 개의 클러스터에서 확인되었다. 최근,오리,얼룩말 핀치 및 닭을 포함한 여러 조류 종의 게놈을 분석 한 결과,각 종의 게놈에는 100%-디펜신 클러스터가 포함되어 있음이 밝혀졌습니다. 최근 코모도 드래곤과 밀접한 관련이있는 아놀 도마뱀(프리켓,메릴랜드,미공개 작업)에서 발견 된 유전자 클러스터와 같은 유전자 클러스터가 확인되었습니다. 흥미롭게도,카 텝신 비 유전자(카 텝신 비)는 인간,쥐 및 닭에서 100%-디펜신 클러스터에 대한 강력한 마커로 확인되었습니다. 따라서,우리는 코모도 게놈 카 텝 신 유전자에 대 한 검사(고환)잠재적인 마커 식별에 도움이 되는 내부-디펜신 클러스터(들).
이러한 분석을 통해 우리는 코모도 드래곤 게놈에서 총 66 개의 잠재적 인 코모도 드래곤-디펜 신 유전자를 확인했으며,그 중 18 개는 코모도 드래곤-특이 적인 코모도 드래곤-디펜 신 유전자로 생각됩니다(표 2). Β 착 색에 대 한 방어에 역할 확인된 유전자에서 코모도 용 게놈 전시에 변화 시스테인 간격,유전자 크기의 숫자 시스테인 잔류 구성하는 β 착 색에 대 한 방어에 역할 도메인뿐만 아니라,수 β 착 색에 대 한 방어에 역할 도메인이 있습니다. 시스테인 잔기 간격에 관하여,특히 끝에서(씨–엑스 6–씨–엑스(3-5)–씨–엑스(8-10)–씨–엑스 6–참조),우리는 코모도 드래곤 게놈에서 우리의 분석에서 상당한 변동성을 발견 5 코모도 드래곤-디펜 신 유전자는 마지막 시스테인 사이에 7 개의 상주하고,16 개는 마지막 시스테인 사이에 6 개의 잔기를 가지며,42 개는 마지막 시스테인 사이에 5 개의 잔기를 가지며,3 개의 코모도 드래곤-디펜 신 유전자는 마지막 시스테인 사이에 복잡한 시스테인 잔류 물 간격 패턴(표 2).
조류 및 다른 파충류와 마찬가지로 코모도 드래곤 디펜 신 유전자의 대부분은 동일한 신 테닉 블록 내의 두 개의 개별 클러스터에 존재하는 것으로 보입니다(그림 1). 3). 한 군집은 1 개의 끝에,켈 혈액 그룹 복합체 서브 유닛 관련 가족,구성원 6 에 대한 유전자에 의해,다른 한 군집은 미오 투 불라 린 관련 단백질 9 에 대한 유전자에 의해 측면에있는 오보 데펜신 클러스터입니다. 본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면, 3). 조류,거북 및 악어에서,다른 쪽 끝에는 전좌 관련 막 단백질 2(트램 2)에 대한 유전자가 뒤 따른다. 조사 된 다른 모든 스콰 메이트(도마뱀과 뱀)게놈의 경우와 마찬가지로,유효한 손상되지 않은 클러스터를 가진 스콰 메이트 게놈이 없기 때문에,디펜 신 클러스터의 끝 부분에 대한 측면 유전자는 현재 결정적으로 결정될 수 없다.
β 착 색에 대 한 방어에 역할이 유전자 가족 클러스터입니다. 확인 된 코모도 드래곤 디펜 신 및 오보 데펜 신 유전자의 발판 위치,코모도 드래곤 게놈에서 디펜 신 및 오보 데펜 신 클러스터를 강조
이 클러스터의 끝 부분은 전차 1 또는 전차 2 에 의해 측면에있을 수 있거나 둘 다있을 수 없습니다. 스캐 폴드 45 에서 발견 된 3 개의 유전자 중 2 개는 거의 동일하며 잠재적으로 어셈블리 아티팩트의 결과입니다. 유전자는 조류,거북이 및 악어의 최종 유전자에 대한 직교 자입니다. 이 유전자에 대한 아놀 오르톨로그는 분리되어있으며,아놀 트램 2,엑스포 1,또는 다른 어떤 디페니신과도 연관되어 있지 않으며,아놀 트램 2 의 근접에서 발견된 디페니신은 없다. 2 개의 유전자는 5 개의 아놀레 유전자 중 하나를 가지고 있지만,이들 유전자가 나머지 2 개의 아놀레 유전자 중 하나이거나 추가 클러스터 중 일부인 경우 어느 종에서 결정될 수 없다. 뱀 직교체는 트램 2 와 관련이 있지만 클러스터의 일부가 아닙니다.
구조적 다양성
다양성은 제 2-디펜신 도메인의 구조의 변화에서 볼 수 있다. 전형적으로,신호 펩타이드,프로피스를 갖는 엑손 및 6 개의 시스테인을 갖는 엑손 및 경우에 따라 짧은 제 3 엑손과 같은 2-3 엑손으로 구성된다. 2013 년 1 월 1 일,2013 년 1 월 1 일,2013 년 1 월 1 일,2013 년 1 월 1 일,2013 년 1 월 1 일,2013 년 1 월 1 일,2013 년 1 월 1 일,2013 년 1 월 1 일,2013 년 1 월 1 일,2013 년 1 월 1 일,2013 년 1 월 1 일,2013 년 1 월 이 두 가지 유형의 도메인에는 두 가지 유형의 도메인이 있으며 두 가지 유형의 도메인에는 두 가지 유형의 도메인이 있습니다. 코모도 드래곤-디펜신 유전자,디펜신 12,디펜신 13 및 디펜신 14 및 아놀의 그들의 직교체는 비정형 적으로 큰 엑손을 갖는다. 또한,이 그룹의 엑손은 일반적으로 큰 엑손을 가지고 있습니다. 시스테인 잔기 사이의 비정형 간격은 세 가지에서 발견됩니다.-디펜 신 20(1-3-9-7),디펜 신 57(3-4-8-5)및 디펜 신 79(3-10-16-6). 시스테인 잔기를 추가로 갖는 4 개의 디페신-디페신-디페신 도메인이 있다.: 시스테인 잔기는 시스테인 잔기가 10 개이고,시스테인 잔기가 3 개이고,시스테인 잔기가 8 개이고,시스테인 잔기가 16 개이고,시스테인 잔기가 17 개이고,시스테인 잔기가 8 개이다.
2 개의 디펜신 도메인은 1 개의 디펜신 도메인과 1 개의 디펜신 도메인과 다른 스콰마타의 직교체와 상동이다. 아놀 리넨시스에는 두 개의 직교가 있습니다. 뱀의 직교자(5 및 6)는 1 개의 직교자(5 및 6)는 1 개의 직교자(5 및 6)는 1 개의 직교자(5 및 6)를 갖는다. 이 경우,뱀은 뱀의 몸체에 부착되어 있습니다. 본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따르면,본 발명의 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 따른 실시예에 VkBD40 한 β 착 색에 대 한 방어에 역할 도메인은 동종의 두 번째 exons 의 LzBD52,LzBD53,LzBD54(중 하나 착 색에 대 한 방어에 역할도메인)및 LzBD55.
제 2-디펜신 도메인에서 시스테인의 수가 증가하면 추가적인 디설파이드 브릿지가 형성될 가능성이 있다. 이 변이의 예는 프시타신에서 찾을 수 있습니다. 10 개의 시스테인으로 구성된 것으로 보이며,그 중 4 개는 전형적인 시스테인-디펜신 도메인과 추가로 짝을 이루는 시스테인(씨-엑스 6-씨-엑스 4-씨-엑스 9-씨-엑스 6-씨-엑스 7-씨-엑스 7-씨-엑스 5-씨)이후 확장의 일부이다. 코모도 그룹은 전형적인 시스테인 간격을 갖는 것 외에도 전형적인 잔기 수 내에 8 개의 시스테인을 갖는다. 그러나,디펜신 도메인은 보다 전형적인 6 개의 시스테인 잔기를 포함하고 있다.
이들 코모도-디펜신 유전자의 유전자 구조는 뒷받침되는 증거와 함께 확인될 수 있다. 아놀 도마뱀에는 추가적인 비-디펜 신 도메인 엑손 또는 더 큰 엑손을 포함하여 많은 비정형 구조 요소가 있습니다.
새로 확인 된 코모도 드래곤-디펜 신 유전자에 의해 인코딩 된 펩타이드 서열을 분석 한 결과,이들 중 대다수(66 개 중 53 개)가 생리 학적 조건에서 순 양전하를 가질 것으로 예측된다는 사실이 밝혀졌습니다. 그 결과,펩타이드는 중성 또는 중성(+0.5–0)인 것으로 예측되고,펩타이드는 중성 또는 중성(+0.5-0)인 것으로 예측되고,펩타이드는 중성 또는 중성(+0.5-0)인 것으로 예측되고,펩타이드는 중성 또는 중성(+0.5-0)인 것으로 예측되고,펩타이드는 중성 또는 중성(+0.5-0)인 것으로 예측되고,펩타이드는 중성 또는 중성(+0.5-0)인 것으로 예측되고,펩타이드는 중성 또는 중성(+0.5-0)인 것으로 예측된다.강하게 음이온성에 약하게 하기 위하여. 이러한 연구 결과는 이들 펩티드가 정식-디페신 구조적 특징을 나타내고,제 2-디페신 유전자 클러스터에 상주하는 동안,이들 유전자 중 하나 이상이 일반적으로 양이온 성이고 그들의 양전하가 그들의 항균 활성에 기여하기 때문에,제 2-디페신 유사 펩티드 또는 정식-디페신-디페신에 대해 인코딩하지 않을 수 있음을 시사한다.
코모도 드래곤 오보 데펜신 유전자
의 식별 오보 데펜신 유전자는 여러 조류 및 파충류 종에서 발견되었으며,계란 흰자 및 기타 조직에서 발현이 발견되었습니다. 닭 펩타이드 갈린(갈루스 갈루스 오보다 1)을 포함하는 오보데펜신은 그람 음성 대장균 및 그람 양성 황색균에 대해 항균 활성을 갖는 것으로 나타났다. 추정되는 오보데펜신은 조류 및 파충류의 신테닉-디펜신 클러스터와 동일한 신테닉 블록의 클러스터에서 발견된다. 2013 년 12 월 19 일,2013 년 12 월 15 일,2013 년 12 월 15 일,2013 년 12 월 15 일,2013 년 12 월 15 일,2013 년 12 월 15 일,2013 년 12 월 15 일,2013 년 12 월 15 일,2013 년 12 월 15 일,2013 년 12 월 15 일,2013 년 12 월 15 일,2013 년 코모도 드래곤 클러스터는 6 개로 구성됩니다.-오보 데펜 신(표 4 및 5). 이 중 두 개는 코모도 드래곤 특정 일 수 있습니다. 이 두 가지 유형의 도메인 중 일부는 다음과 같습니다. VkOVOD4 및 VkOVOD6 는 orthologs 의 LzOVOD14.
코모도 드래곤 카텔리시딘 유전자
카텔리시딘 펩타이드 유전자의 확인은 최근 유전체학 접근법을 통해 파충류에서 확인되었습니다. 몇몇 카텔리시딘 펩티드 유전자는 새,뱀 및 아놀레 도마뱀에서 확인되었습니다. 기능성 카 텔 리 시 딘 항균 펩 티 드의 릴리스 파충류 이종 또한 이러한 펩 티 드의 원천이 될 수 있습니다 제안 닭 이종에서 관찰 되었습니다. 알리바르디 외. 카텔리시딘 펩티드가 이종 세포와 관련된 것을 포함하여 아놀레 도마뱀 조직에서 발현되는 것을 확인했습니다. 카텔리시딘 항균성 펩티드는 그밖 동물에 있는 타고 난 면제에 있는 핵심 역활을 하고 그래서 아마 코모도 용에 있는 이 역할을 또한 하고 생각됩니다.
아놀레 도마뱀에서 4 개의 유전자로 구성된 카텔리시딘 유전자 클러스터는 다음과 같이 구성된다. 우리는 코모도 드래곤 게놈에서 비슷한 카 텔 리 시 딘 클러스터에 대 한 검색. 카테 리시 딘 유사 유전자에 대한 코모도 드래곤 게놈을 검색하면 사폴드 84 의 한쪽 끝에 위치한 카테 리시 딘 유전자의 첫 번째 요구 사항 인”카테 린 유사 도메인”을 가진 세 개의 유전자 군집이 밝혀졌습니다. 그러나,스캐 폴드(84)의이 영역에는 갭,격리 된 엑손 및 중복과 관련된 어셈블리 문제가 있습니다. 확인 된 코모도 드래곤 카텔리시딘 유전자는 아놀레 오르톨로그의 이름을 따서 명명되었습니다. 두 코모도 드래곤 카텔리시딘(카텔리시딘 2 및 카텔리시딘 4.1)는 조립 문제가없는 섹션에 있습니다. 대조적으로,카텔리시딘 4.2 는 다양한 엑손 1-3 세트와 잘못 배치 된 엑손 4 를 사용하여 완전한 유전자를 생성했으며,이는 카텔리시딘 4.1 과 유사합니다. 스캐 폴드의 한쪽 끝에서 클러스터가 발견되면,이 어셈블리에서 캡처되지 않은 추가 미확인 카텔리시딘이있을 수 있습니다.
카텔리시딘 항균 펩타이드 유전자 서열의 일반적인 특징은 엔-말단 카텔린-도메인이 적어도 4 개의 시스테인에 대해 암호화된다는 것이다. 악어와 뱀 카 텔 리 시 딘의 우리의 연구에서 우리는 또한 일반적으로 다음 마지막 시스테인,3 잔류물 패턴 즉시 예측된 다 말단 양이온 항균 펩 티 드 선행 또는 유사한 시퀀스로 구성 된 주목 했다. 카텔리시딘 항균성 펩타이드 유전자 서열의 추가적인 요구사항은 그것이 씨-말단 영역에서 순-양전하 펩티드에 대해 암호화하는 것이고,그것은 전형적으로 제 4 엑손에 의해 암호화되고,전형적으로 길이(범위 25-37)에서 약 35 단이다. 기능성 항균 펩 티 드의 분열 및 방출에 대 한 책임은 자연스럽 게 발생 하는 프로테아제 알려져 있지 않다,이후 정확한 절단 사이트의 예측은 어렵습니다. 표 6 에서 알 수 있는 바와 같이,확인된 코모도 드래곤 카텔리시딘 유전자 후보 각각에 대해 예측된 아미노산 서열이 나열되어 있다. 각 시퀀스에 대 한 우리의 분석을 수행,우리는 예측 및 각 잠재적인 카 텔 리 시 딘 유전자 항균 펩 티 드에 대 한 인코딩할 수 있습니다 여부에 대 한 결론을 했다.
시스테인(밑줄이 그어진 표 6)이 4 개 포함되어 있음을 알 수 있다. 그러나,우리가 악어 및 관련 카텔리시딘 서열에서 보았 듯이 마지막 시스테인 잔기에 이어~10 개의 아미노산에 명백한”브르르”또는 유사한 서열이 없다. 또한,35 씨 터미널 아미노산의 분석 그물 긍정적인 충전 부족 예측된 펩 티 드 시퀀스를 보여준다. 이러한 이유로,우리는 카 텔 리 시 딘 2_바 코 유전자 시퀀스 활성 카 텔 리 시 딘 항균 펩 티 드의 종점(표 7)에 대 한 인코딩하지 않습니다 예측.
확인된 카텔리시딘 4.1_바르코 유전자에 대해,예측된 카텔린-도메인은 필요한 4 개의 시스테인 잔기를 포함하고(표 6),서열”브이텔리시딘”은 악어 카텔리시딘 유전자의”브이텔리시딘”서열과 유사한 마지막 시스테인의 10 개 아미노산 내에 존재한다. 이 펩티드는 생리 학적 산도에서 순+12 전하를 가질 것으로 예측되며,서열의 상당 부분은 나선형으로 예측되며,이는 카텔리시딘과 일치합니다. 알려진 카텔리시딘의 대부분은 중요한 나선형 구조를 가진 세그먼트를 포함합니다. 마지막으로,항균성 펩티드 데이타베이스를 사용하여 서열의 분석은 펩티드가 잠재적으로 양이온 항균성 펩티드이다는 것을 나타낸다. 따라서,우리는이 유전자 가능성이 활성 카 텔 리 시 딘 항균 펩 티 드에 대 한 인코딩 예측.
또한,이 펩타이드는 항균 펩타이드 데이터베이스(표 8)에서 다른 공지된 항균 펩타이드와 일부 상동성을 나타낸다. 그것은 표 8 에 포함 된 예와 함께 스쿼 메이트로부터 확인 된 카테 리시 딘 펩타이드와 특히 높은 수준의 서열 유사성을 보여줍니다. 따라서,예측된 카텔리시딘 펩티드는 카텔리시딘 펩티드의 많은 특징 특성을 가지고 있으며,추가 연구를 위한 강력한 후보자이다. 표 8 은 항균 펩타이드 데이터베이스에 알려진 펩타이드와 함께 배향을 나타낸다.
확인된 카텔리시딘 4.2_바코 유전자에 대해,예측된 카텔린 도메인은 필요한 4 개의 시스테인 잔기를 포함한다(표 6). 카테 리시 딘 4.1_바르코 유전자에서 언급 된 바와 같이,서열”브이 토르”는 네 번째 시스테인 잔기의 10 아미노산 내에 존재하며,즉시 항균성 인 것으로 예측되는 30-단 펩타이드에 대해 암호화하는 씨-말단 세그먼트에 선행한다. 다 터미널 펩 티 드의 아미노산 시퀀스는 생리 적 산도에서 그물+10 충전 예측 하 고 항균 성 펩 티 드 데이터베이스에 다른 알려진된 항균 성 펩 티 드 상 동성의 다양 한도을 보여 줍니다. 따라서,이 후보 펩티드는 또한 카텔리시딘 펩티드와 관련된 많은 특징 특성을 나타내며,추가 연구를위한 두 번째 강력한 후보이다. 표 8 은 항균 펩타이드 데이터베이스로부터 알려진 펩타이드와 상 동성 및 정렬을 나타낸다. 마지막으로,기능성 펩티드를 코딩하는 유전자 서열은 엑손 4 에서 발견되며,이는 활성 카텔리시딘 펩타이드의 전형적인 위치이다. 이 엑손은 펩타이드 서열을 암호화합니다.이 두 가지 유형의 펩타이드는 다른 유형의 카텔리시딘 유전자로부터의 펩타이드와 매우 상동성이 있으며,이들 펩타이드는 다른 유형의 카텔리시딘 유전자로부터의 펩타이드와 유사하며,이들 펩타이드는 다른 유형의 카텔리시딘 유전자로부터의 펩타이드와 유사하다. 2-27 잔류물.이 두 가지 유형의 아놀레 카테 리시 딘-2 와 유사하며,이 두 가지 유형의 아놀레 카테 리시 딘-2 와 유사하다. 잔류 2-30 의 VK-CATH4.2 은 66%가 동일하고 82%유사한 도마뱀 Cathelicidin 관련 예측 C-terminal 펩티드(XP_015277841.1,aa129-151). 마지막으로,aa2-24 의 VK-CATH4.2 은 57%가 동일하고 73%유사한 Cathelicidin 관련 OH-캐 같이 예측 C-terminal 펩티드(XP_007445036.1,aa129-151).