żywe małże są bardzo łatwo psujące się i bardzo podatne na zanieczyszczenia bakteryjne po ich śmierci lub zbyt ciepłym, więc muszą być utrzymywane przy życiu, aż będą gotowe do ugotowania i zjedzenia. Przechowywać żywe małże w zimnej (32 do 35 stopni Fahrenheita) lodówce w otwartym pojemniku, przykrytym wilgotną szmatką lub papierowymi ręcznikami. Utrzymywane w ten sposób żywe małże powinny pozostać świeże przez dwa do trzech dni. Nie umieszczaj żywych małży w hermetycznym pojemniku ani nie zanurzaj ich w słodkiej wodzie; albo je zabijesz. Sprawdzaj codziennie, czy nie ma otwartych muszli-znak, że małż umarł – i usuń te małże natychmiast, aby nie zanieczyściły reszty. Żywe małże można również zamrozić w skorupie i przechowywać do trzech miesięcy. W tym celu należy umieścić żywe małże w workach odpornych na wilgoć, wycisnąć nadmiar powietrza i zamrozić.
w przypadku shucked małże powinny wyglądać pulchne, być zanurzone we własnym czystym alkoholu i pachnieć świeżo, absolutnie bez zapachu rybnego lub amoniaku. Shucked małże są również dostępne w puszkach lub już zamrożone. Pokrojone małże należy przechowywać w szczelnie zamkniętym pojemniku zanurzonym we własnym roztworze. Przechowywane w lodówce pozostaną świeże przez okres do trzech dni. Pokrojone małże można również zamrozić. Dokładnie oczyścić i umyć mięso, a następnie odcedzić i zapakować w pojemnikach zamrażarki, pozostawiając 1/2 cala przestrzeni nad głową. Zużyć w ciągu trzech miesięcy. Gdy jest gotowy, rozmrozić zamrożone małże w lodówce przez sześć godzin.